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病原微生物宏基因组检测工程师考试试卷及答案

一、填空题（每题1分，共10分）

1.病原微生物宏基因组学是指直接从______中提取所有微生物核酸进行测序分析的技术。

2.宏基因组短读长测序常用平台为______，长读长平台为______（如PacBio/Nanopore）。

3.样本处理中，宿主核酸去除的核心是减少______核酸对微生物信号的干扰。

4.宏基因组数据分析第一步通常是______（去除低质量reads、接头等）。

5.物种注释常用数据库包括NCBInt/nr、______（如Kraken2）等。

6.宏基因组组装常用工具为MEGAHIT、______（如SPAdes）。

7.耐药基因注释常用数据库是______（如CARD/ResFinder）。

8.临床血液样本宏基因组检测前常需______（离心/过滤）富集微生物。

9.测序覆盖度公式：______（reads数×平均读长）/基因组大小。

10.病毒宏基因组检测需去除______（宿主+细菌）核酸以提高病毒序列占比。

答案：

1.临床/环境样本

2.Illumina；PacBio（或Nanopore）

3.宿主（人类/动物）

4.序列质控（rawdata预处理）

5.Kraken2数据库（或RefSeq）

6.SPAdes

7.CARD（或ResFinder）

8.微生物富集

9.（reads总数×平均读长）

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