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基于配体的药物设计(LBDD)汇报人：药物设计研究组

目录LBDD概述与基本原理定量构效关系(QSAR)药效团模型相似性搜索与虚拟筛选AI驱动的新范式前沿展望与总结010203040506

LBDD概述与基本原理01

LBDD的定义与核心思想基于配体的药物设计（LBDD）Ligand-BasedDrugDesign,LBDD是一类在靶标蛋白三维结构未知条件下，利用已知活性配体的结构信息指导新药发现与优化的方法体系1结构特征分析通过分析已知活性配体的结构特征推导配体-靶点相互作用模式2结构相似性原理结构相似的化合物倾向于具有相似的生物活性3逆向推断策略从配体端逆向推断靶点结合位点的性质与空间约束SBDD依赖靶点三维结构量体裁衣?互补整合提升效率LBDD依赖配体信息量衣裁衣

LBDD的适用场景与优势LBDD核心适用场景膜蛋白靶点结构未测定有活性配体不依赖靶点结构降低对结构生物学数据的依赖，突破晶体培养瓶颈快速先导优化从已知活性化合物出发，加速早期药物发现成熟且低成本方法成熟、计算成本相对较低，适合早期阶段缺乏原子级细节无法提供配体-靶点结合的原子级相互作用信息依赖训练数据模型质量高度依赖训练数据的数量与质量化学空间受限全新骨架发现能力受限于已知化学空间的覆盖范围

LBDD方法体系总览定量构效关系QSAR建立化合物结构描述符与生物活性之间的定量数学模型包括2D-QSAR（Hansc