药物分子设计和核酸的分子识别分析.pdfVIP

第 14 卷第 3 期 　　　　　　　　　 分 析 科 学 学 报 1998 年 7 月 . 14 . 3　　　　　　 . 　1998 V o l N o JOU RNAL O F ANAL YT ICAL SC IEN CE Jul 药物分子设计和核酸的分子识别分析 曹　瑛　　何锡文 (南开大学化学系, 天津, 300071) 摘　要　分子识别分析理论应用于药物分子设计是新药开发的要求, 也是分析化学一个 极具潜力的发展方向 分子识别分析不仅为药物分子设计提供了生物大分子的组成、结 构等基本信息, 还为了解药物分子与生物大分子相互作用位点及作用方式提供了模型 本文评述了与药物分子设计有关的核酸物质的分子识别分析, 它们是设计好的抗癌药物 的基础 关键词　药物　 　分子识别分析　评述 DNA 1　前言 药物分子设计一直是一个受到人们关注的传统研究领域, 化学理论的介入, 使其有了扎 ( ) ( ) 实的理论基础 药物分子的药理作用涉及的是药物小分子 主体 对生物大分子 客体 特定 部位的识别作用对整个大分子构象产生的影响 因此, 分子识别分析理论的发展, 尤其是对 生物大分子分子识别分析研究, 无疑是合理、高效的药物分子设计的基础 基因药物由于能 够直接作用于遗传物质——核酸, 而成为一些疑难病症, 如癌症的特效药物 因此, 核酸物 质的分子识别分析研究对好的基因药物分子设计有着重要意义 与药物分子设计有关的核 ( ) 酸分子识别作用位点及方式的研究包括对核酸一级结构 即碱基序列 的分析, 分子识别作 用位点及方式的研究 脱氧核糖核酸(DNA ) 平行堆积的碱基, 聚合的阴离子磷酸骨架, 以 及两条核苷酸链螺旋形成的大沟( ) 和小沟( ) 构成了分子识别的 M ajo r Groove M ino r Groove 位点 现代分析化学已突破了经典分析化学的概念与理论, 吸收其它各学科的最新成果, 成为 一门重新蓬勃发展的边缘交叉学科 与药物化学的交叉发展, 是分析化学的一个发展方向 [ 1 ] 因此, 我们在前文的基础上 , 再深入写此文, 以期引起同行对前沿学科领域发展的注意 2　碱基的分子识别 自然界中的碱基互补配对原则是碱基分子识别的基础 但在水溶液或模拟细胞液中, 由于水的强烈形成氢键作用, 阻碍了碱基间的氢键形成 利用氢键作为主要作用力, 再辅以 其他非共价键作用的多位点分子识别是碱基分子识别所具有的特点 等人设计 H am ilton ( ) [ 2 ] 的柔性大环主体分子利用多位点作用对胸腺核苷有很好的识别能力 图1 : 氢键使得分子 收稿日期:　　通讯联系人: 何锡文 本文系国家自然科学基金和国家教委博士点基金资助课题 244 © 1995-2006 Tsinghua Tongfang Optical Disc Co., Ltd. All rights reserved. 识别具有选择性, 疏水作用加强了识别作用, 阳离子基团用