复合物M-cytosine（M=Ca^＋、Ca^2＋、Mg^＋和Mg^2＋）的振动分析.pdfVIP

第44卷 第 11期 山 东 大 学 学 报 (理 学 版) 2oo9年 11月 V01．44 No．11 JournalofShandongUniversity(NaturalScience) NOV．2009 文章编号：1671—9352{2009)11-0021-04 复合物 M—cytosine(M=Ca+、Ca 、Mg+和 Mg2+)的振动分析 张兴初 ，孙志兵 (广州科技贸易职业学院机 电系，广东 广州 511442) 摘要：采用密度函数理论的Becke三参数交换能和LYP关联能混和泛函B3LYP，在 6-311+g(2df，2p)基组水平上， 优化获得 了钙、镁的一、二价离子与胞嘧啶分子的各互变异构体形成复合物稳定结构，并在此基础上进行频率计 算。根据计算结果，对比分析了一、二价钙、镁离子与相同嘧啶分子形成稳定复合物的振动情况。从分析结果看， 由于离子的作用，振动特征会发生相应的变化，主要表现在与离子直接作用的那个原子在参与环的振动时，频率 和振幅都发生变化，产生这种变化的原因是 由于离子与单体嘧啶分子的不同位置作用，改变了单体分子的作用力 常数和质量因素，引起振动模式的改变，从而改变振动特征。 关键词：密度函数；振动；频率；胞嘧啶 中图分类号：0641．3 文献标志码：A FrequencyanalysisofcomplexesM—cytosine(M=Ca ， Ca ，MgandMg2) ZHANG Xing-chu，SUN Zhi—bing (DepartmentofElectromechanicalEngineering，GuangzhouPolytechnicofScinceandTrade， Guangzhou511442，Gtmngdong，China) Abstract：Thecomplexesstablestructureswereobtained，whichwerecomposedofcalcium andmagnesimu bivalentcationsand cytosine，bytheoptimizationwihtdensityfunctionhteoryathteB3LYP／6—311+G(2df，2p)leve1．Thevibrationalfrequencywas calculated，andhteatomsvibrationwasanalyzed．Somevibrationmodesbelongingtohteobviousfrequenciesof htecomplexes werediscussed．Accordingtohteresults，htefreuqenciesobviouslychangedwhenhtepyrimidinemonomeractde wiht htecations． Thismainlybecaues htecanonscouldtakepartinhtemolecule’Svibrationsandchangehteforcecoustan~nadeffectiven1ass． Keywords：densityfunction；fibmfion；freuqency；cytosine 计算获得其结构和振动谱对理解分子复合物结构和 0 引言 实验测量都有重要意义。金属离子与核酸共存于体 液中，研究金属离子与核酸碱基的作用很有必要，近 随着生命科学发展的要求，了解核酸微结构的