应用多因子降维法MDR分析基因-基因的交互作用.pdfVIP

中国老年保健医学》杂志2012年第l0卷第6期 ·论 善 · 应用多因子降维法 MDR分析基因一基因的交互作用 王娜娜 ， 张毓洪 杨 泽 作者单位：1卫生部北京医院，卫生部老年 医学研究所 100730 2宁夏医科大学公共卫生学院 750004 基金项目：国家自然科学基金项目(编号81061120527)资助。 摘【要】 目的 介绍在遗传流行病学病例对照研究中，应用多因子降维法(MDR)分析基因一基因交互作用。方法 简述 MDR的基本步骤、原理及其优缺点，并结合研究实例说明在病例对照研究中进行 MDR分析。结果 相对于传统的统计学 方法，MDR是一种无参数、无遗传模式的分析交互作用的方法，理论和实例研究均表明其分析交互作用具有较好的效能，目 前 已成功应用于散发性乳腺癌、心房颤动和原发性高血压等疾病的研究。结论 MDR能够应用于病例对照研究进行基 因 一 基因交互作用的分析，且具有较传统的统计学分析方法无法比拟的优势。 【关键词】 病例对照研究 多因子降维法 基因一基因交互作用 doi：10．3969／j．issn．1672—4860．2012．06．007 Theapplicationofmultifactordimensionalityreductionfordetectinggene-geneinteractions(WANGNana ，ZHANGYu— hong2 ， YANGZe．JSe~nghospital， 100730，China；2Ningxiaunivenity，Yinchuan 750004，China．) A【bstract】Objective TointroducetheapplicationofMuhifactorDimensionalityReduction(MDR)methodfordetectinggene— geneinteractionsingeneticcase—controlstudies．M ethods A briefoverviewonbasicstepsinvolvedintheimplementation，theoreti— ca1details，aswellastheuseandfeaturesoftheMDRmethodwerediscussedbasedonapracticalresearchcase．Results Advanta— gesofMDRwerecomparedtotheconventional statistical approaches，showingthatMDRmethodwasanovel，nonparametric，genetic model-freeapproachthatwasdevelopedspecificallyfordetectinggene—geneinteractions．Theoreticalandempiricalstudiessuggested thatMDR washavingreasonablepowerofrdetectinggene—geneinteractions．Applicationsof MDR methodhadofundtheevidenceof gene—gene interactions in several diseases such as sporadic breast cance，atrial fibrillmion and essential hypertension． Conclusion MDR methodcouldbeusedofrdetectinggene--geneinteractionsingeneticcase-，controlstudiesashavinggreatadvan·· tagesversustheconventionalstatisticalapproaches． K【eywords】 Case·controlstudy，Multifactordimensionalityreduction，Gene—geneinteractions 交互作用是指两个或多个因素相互发生作用而产生的一 用将会使模型的效能大