水生动物种群遗传多样性分析的分子生物学技术.pdfVIP

2011年 第46卷 第 10期 生 物 学 通 报 水生动物种群遗传多样性分析的分子生物学技术术 马召腾 潘连德 一 (上海 海洋 大学 省部共建水产种 质 资源发掘 与利用 教育部重 点实验 室 上海 201306) 摘要 针对常用于水生动物种群遗传 多样性 分析 的RFLP、AFLP、RAPD、SSR 和 ISSR 等技 术方法 ，进行 了较为系统全面的 比较、归纳、分析 ，并根据这些DNA指纹技术在各种水生动物研 究中的应用实例 ，探讨和阐述 了其优缺 点，为水生生物遗传 多样性研 究找 出最适合的试验方法。 关键词 鱼类种群 遗传 多样性 分子生物学技术 中国图书分类号 ：Q75+Q958．8 文献标识码 ：A 随着生物技术 的不断发展 ，人们对生物种群 amplifiedpolymorphicDNA，随机扩增 多态 DNA)、 的研究越来越多元化 ，同时面对物种的逐渐锐减 ， VNTRs(variablenumbertandem repeats．可变 数 目 保护各种群 的生殖延续和保护种群 自身 的遗传 多 串联重 复 )、DNA 测序 、AFLP(amplifiedrfagment 样性 ，成为世界性关注的焦点。综合众多学者 的研 lengthpolymorphism，扩增 片段长度多态性)等。 究不难发现 ，遗传多样性是生物多样性研究 的重 目前 。在种群遗传 多样性研究中应用较为广 要 内容 ，并且种群 内和种群间遗传多样性状况可 泛 的分子生物学技术是微卫星 ．微卫星 DNA 主要 为了解物种遗传背景提供一定的科学资料。 存在于原核和真核生物基因组 中。是有着高度多 20世纪 70年代开始 ，人们开始应用分子生物 态性的短片段 串联重复核苷酸序列 。在人类和其 学技术进行种群生物学研究 ，等位酶是最早被使 他动物 的研究 中发现 ，因为微卫星 DNA有着较高 用 的分子标记 。用等位酶当遗传标记 已经为我们 的多态性 ，因此成为 良好 的遗传标记 ，是天然种群 对种群 的遗传结构 、交配系统、亲本分析和基 因流 和亚种群区分 的重要工具 ，也是进行种群遗传 结 等方面 的研究提供了很大的帮助 ，但是 由于等位 构和遗传多样性研究 的有效 的分子标记 。 酶在应用上有一定局限性 ，很 多极具意义的研究 1 种群遗传多样性的常用分子生物学技术 工作无法开展 ，尤其是那些需要 了解种群 内个体 1．1 RFLP分析 方法 和应 用 RFLP(restriction 间遗传关系信息的研究。 rfagmentlengthpolymorphism．限制性 内切酶片段 20世 纪 90年代 以后 ，随着 PCR技术 的广泛 长度 多态性 )分析技术 ，是 由Botesion等在 1980 应用 ，DNA 的多态性 可通 过体外 克 隆被快 速 、高 年 创立 的 ，也是 出现最 早 ，普 遍采用 的 DNA标记 效地检测 出来 ．于是 出现 了基于 PCR 的 RFLP、 方法 ，它开创 了直接应用 DNA多态性 的新阶段。 RAPD、SSR和 AFLP等新的DNA指纹技术 ，这些 RFLP是指一个物种 的 DNA被某种特定 限制 现代分子生物学技术和传统 的依赖形态学进 行种 性 内切酶 消化而产生 DNA片段长度 的变异性 。这 群研 究不 同 ，它能够为种群生物学 的研究提供 更 种变异 的产生是 因为单个碱基的突变而导致 的限 为灵敏有效 的手段 。 制性酶切位点的增加或者消失 ：或者 由于 DNA序 近几年 以来 ，分子生物学的研究水平突飞猛 列插入