基于加权组装聚类的蛋白质复合物侦测方法.pdfVIP

基于加权组装聚类的蛋 白质复合物侦测方法 欧阳乐 ，戴道清 ， 晓飞 中山大学数学与计算科学学院，广州　 摘要 ：通过蛋 白质相互作用网络侦测蛋 白质复合物是计算生物学的一个重要任务。 目前，科研 人员已经提 出了许多计算方法来侦测蛋 白质复合物。然而，由于每种算法通常只能考虑到网络 的某一方面特征，不同算法在 同一个网络上的性能可能大相径庭。即使是 同一个算法，在具有 不同拓扑结构的网络上也会表现 出不同的性能。可 以把不同算法的聚类结果看成从不同角度描 绘 网络的不同“特征 ”。这样，如何利用这些 “特征 ”产生更为准确和可靠的聚类结果成为一 个有意义的问题。本文提 出了一种新的基于贝叶斯非 负矩阵分解的加权组装聚类方法来侦测蛋 白质相互作用网络 中的蛋 白质复合物。在 两个酵母蛋 白质相互作用网络数据库上的实验结果验 证 了本文方法在侦测蛋 白质复合物方面的有效性。本文提供了一种可 以融合不同聚类结果的更 为准确和可靠的复合物侦测方法。 关键词 ：生物信息学，蛋 白质相互作用网络，蛋 白质复合物加权，组装聚类 中图分类号 ： ， 基金项 目： ， 作 者简 介 ： （） （）