CBF3基因的克隆、生物信息学分析及植物表达载体的构建.pdfVIP

CBF3基因的克隆、生物信息学分析及植物表达载体的构建.pdf

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湖南农业科学 2009,(2):1-3,6 HunanA culturalSciences CBF3基因的克隆、生物信息学分析及植物表达 载体的构建 刘 俊 -,,蔡平钟 ,马 林 ,张志雄 ,向跃武 , 张志勇 ,蒲志刚2,王闵霞 f1.西南科技大学生命科学与工程学院,四川 绵阳621000; 2.四川省农业科学院生物技术核技术研究所,四川 成都610066) 摘 要:bk拟南芥基因组DNA中分别克隆了CBF3基因和逆境诱导型启动子Rd29A,测序结果显示:克隆的CBF3基因长776 bp,编码216个氨基酸,与GeneBank公布的的序列相比对,核苷酸同源性达到99.2%,并利用生物信息学手段对其氨基酸序 列、进化树、理化性质、疏水性,亲水性等进行分析;启动子Rd29A全长为956bp,与已报道的该启动子序列比较,其核苷酸同源 性为99.5%。以双元载体pCAMBIA1301为基础,成功构建了植物表达载体pCAMBIA1301一Rd29A—CBF3,为利用CBF2基因提 高植物的耐寒性创造了条件。 关键词:CBF3;启动子;克隆;生物信息学;植物表达载体 中图分类号 :Q943.2 文献标识码:A 文章编号:10o6—060X(2009)02—0001—03 Cloning,BioinformaticsAnalysisofCBF3andConstructionof PlantExpressionVector LIUJun’.-,CAIPing-Zhong坦,MA Lin’,ZHANG Zhi-Xiong,XlANG Yue-wu, PUZhi-gang,ZHANG Zhi-yong,WangMin-xia2 仃.CollegeofLifeScienceandEngineering,SouthwestUniversityofSceinceandTechnology,Mianyang621000,PRC; 2.1nstituteofBiotechnoolygandNucelarTechnoloyg,SichuanAcademyofagicuhuralSceinces,Chengdu610066,PRcJ Abstract:C-repeatbindingfactor3andhypothermalinducerpromoterRd29Awere amplifiedfrom thegenomic DNA ofArabidopsisthalianaColumbia.Sequencingresultsshowed thattheclonedCBF3genehas776bpsanden— codes216aminoacids.andhas99.2% identitywithhtesequencepublishedonGeneBank.Themethodsofbioinfor- matiesare印pliedtoanalyzethesimilarityofaminoacidsequences,phylogenetictree,physico—chemicalpropertyand hydrophobicityandhydrophilia;thepromoterRd29A has956bps.andhas99.5% identitywiththealreadypublished promotersequence.Basedon thebinaryvectorpCAMBIA1301.hteplantexpressionvectorpCAMBIA1301一Rd29A— CBF3Was constructedsuccessfully,whichcouldmateriallyimprovethecold-toleranceabilityofplants. Keywords:CBF3;promotor,clone;bioinformatics;p

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