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SN
中华人民共和国出入境检验检疫行业标准
SN/T XXXX.2—XXXX
入境环保用微生物菌剂检测方法 第2部分:短小芽孢杆菌
Methods for examination of import microbe agentia for environment protection Part 2: Bacillus pumilus
XXXX - XX - XX发布
XXXX - XX - XX实施
中 华 人 民 共 和 国
国家质量监督检验检疫总局发布
前言
本是根据GB/T1.1-1993《标准化工作导则 第一单元:标准的起草与表述规则 第1部分:标准编写的基本规定》的要求编写的。本标准由国家认证认可监督管理委员会提出并归口。
本标准起草单位中华人民共和国辽宁出入境检验检疫局。
本标准主要起草人
本标准系首次发布的出入境检验检疫行业标准。入境环保用微生物菌剂检测方法2部分 短小芽孢杆菌
范围
本标准规定了。
本标准适用于。
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T 4789.28 食品卫生微生物学检验 染色法、培养基和试剂。
GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法。
方法原理
取适量入境环保用微生物菌剂,将菌剂中的菌进行活化、分离,对该菌进行形态学和生理生化试验,并进行,三项实验结果。
实验用水(应符合GB/T6682中一级水的规格)。:见附录A中A.1章:见附录A中A.2章TE缓冲液(pH值8.0):见附录A中A.3章10×PCR缓冲液:200 mmol/L Tris-HCl(pH 8.4),200 mmol/L氯化钾(KCl)15 mmol/L氯化镁(MgCl2)。dNTP: dATP、dTTP、dGTP、dCTP。TBE:54 gTris,27.5 g硼酸,800 ml去离子水溶解,20 ml 0.5 mol/L EDTA(pH 8.0)定容至1 L。Taq DNA聚合酶。细菌基因组DNA提取试剂盒。DNA分子量标记:100 bp DNA ladder。电子天平(感量0.01 g)。36 ℃±1 ℃、50 ℃±1 ℃
恒温水浴锅。
台式离心机(最高转速15 000 r/min)。
PCR扩增仪。
实时荧光PCR仪。
头:10 μL、20 μL、200 μL、1000 μL。
PCR超净工作台。
电泳仪。
核酸/蛋白分析仪。
凝胶成像系统。
。100 μL。
短小芽孢杆菌形态学及生化特征:
短小芽孢杆菌为革兰氏阳性杆菌,细胞直径<1μm + 氧化酶 + 厌氧生长 - 葡萄糖 + 木糖 + L-阿拉伯糖 + + 利用葡萄糖产气 - 利用柠檬酸盐 + 硝酸盐还原 - 50℃生长 + pH5.7生长 + 7%NaCl生长 + - 明胶液化 + 细菌模板DNA的提取
直接提取法
取7.2中菌液2 mL加到2 mL无菌离心管中,10000 rpm离心2分钟,尽量弃净上清,沉淀加入TE100 μL、10 mg/ml溶菌酶100 μL,37 ℃温育30 min,12000 rpm离心2分钟,沉淀加入TE缓冲液600 μL重悬,再加入15 mg/ml蛋白酶K25μL,55 ℃温育1 h后沸水浴10 min,12000 rpm离心5分钟,取上清保存于-20 ℃保存以待检测。
有机溶剂提取法
取7.2中菌液2 mL加到2 mL无菌离心管中,10000 rpm离心2分钟,尽量弃净上清,沉淀加入TE缓冲液570 μL重悬,然后加入10 mg/ml溶菌酶100 μL,37 ℃温育30 min,再加入10 %SDS30 μL,65 ℃温育10 min,加入等体积的酚混匀,12000 rpm离心10分钟,取上清移入一新离心管中,重复一次,两次酚抽提后取上清加等体积的酚/氯仿(1:1体积比)混匀,12000 rpm离心10分钟,取上清再移入一新离心管中,加等体积的无水乙醇,1/10体积的3 mol/L乙酸钠,轻缓颠倒混匀,12000 rpm离心10分钟,弃上清,沉淀用500 μL75 %乙醇洗两次,离心管开盖室温放置数分钟使乙醇挥发,加入100 μL无菌水(预先加热至65 ℃有利于DNA溶解),-20 ℃保存以待检测。
试剂盒法
使用商品化的细菌基因组DNA提取试剂盒,具体提取操作参照说明书进行。
DNA质量检测
将提取的DNA用1.0 %含溴化乙锭(或等效染料)的琼脂糖凝胶进行检测。然后用核酸/蛋白分析仪分别在260 nm和280 nm下测定OD
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