滇型杂交粳稻主要亲本的SSR指纹图谱及其遗传差异分析.pdfVIP

· 54· 杂交水稻(扔 R，z)RICE)，2009，24(6)：54—58 滇型杂交粳稻主要亲本的SSR 指纹图谱及其遗传差异分析 杨 旭，谭学林 (云南农业大学 稻作研究所 ，云南 昆明 650201) 摘 要：用筛选的l3对 SSR引物，构建了41个水稻品种(包括35份滇型杂交粳稻恢复系、保持系材料、2个杂交种以及4个籼稻 品系)的分子指纹图谱。聚类分析表明，41个水稻品种间遗传相似系数在0．52～0．94之间；在相似系数 0．52处，可以将粳稻与籼 稻区分开；在相似系数0．66处，可将杂交粳稻与其它粳稻品系区分开；在相似系数0．71处，又可将大部分恢复系与保持系区分开。 生产中应用的一些强优势滇型杂交粳稻的亲本分别聚于不同的类群，表明亲本间的遗传差异较大。 关键词：滇型杂交粳稻；亲本；SSR；指纹图谱；遗传差异 中图分类号：s511．0l；Q75 文献标识码 ：A 文章编号：1005—3956(2009)06—0054—05 水稻是云南最重要的粮食作物，云南水稻以粳 1．2 方 法 稻为主 ，粳稻种植面积 占全省水稻种植面积的60％ 1．2．1 DNA提取 按 照 Rogers和 Bendich的 以上。粳稻新品种主要靠云南 自己选育…，先后培 CTAB法 (Cetyltrimethylammoniumbromide) 从实 育出了一批独具特色的滇型优质高产杂交粳稻组 验材料的叶片提取 DNA。 合，屡创高产佳绩 J。但是，如何进一步提高滇型 1．2．2 PCR扩增及产物分离 PCR反应体系：10 杂交粳稻的育种效率，仍是育种家们面I临的挑战。 ×PCRBuffer1．25 L，dNTP(2．5mmol／L)1．0 L， 对恢复系和保持系的遗传差异进行研究，是选配优 ForwardPrimer(10ixmol／L)0．25 L，ReversePrimer 良杂交组合的主要基础。分子标记技术的发展为研 (10Ixmol／L)0．25trL，TaqDNA聚合酶(1U)0．065 究滇型杂交粳稻保持系和恢复系的遗传差异提供 了 ILL，DNA模板 (25—40ng／L)0．5 L，ddH2O 有效的工具。SSR(simplesequencerepeat)标记是一 9．185 L，总反应体系为 12．5 L。扩增程序为 种广泛应用、趋于成熟的分子标记 J，具有遗传方 94℃ 5min；94oC30S，55oC30S，72℃30S，40个循 式简单、共显性、多态性好、不需要大量的DNA、操 环 ；72℃5min。扩增产物在2％琼脂糖凝胶中电泳， 作方便、重复性好、稳定性可靠等特点，目前已被广 然后在凝胶成相系统上成相，并保存采集图象。 泛应用于遗传多样性分析、种质鉴定、DNA指纹图 1．3 数据处理 谱构建以及标记辅助选择等方面 “。为更好地鉴 根据各水稻DNA样 品的电泳条带结果进行赋 别生产上的真假种子，保障种子生产者和用种农户 值，即每对 SSR引物检测 1个位点，将观测到的每 的利益，以及为更加有效地利用恢复系、保持系，选 条带视为一个号码，有此带赋值为 l，无此带赋值为 配强优势的杂交组合，笔者应用SSR技术构建了滇 0。同时，采用上述赋值结果，计算材料间的Nei’S 型水稻主要恢复系、保持系和生产上应用品种的分 遗传距离 ：GD：1—2Mxy／(Mx+My)；其中 子指纹图谱，并对供试材料的遗传差异进行了分析。 和My分别为材料x和Y的带数，Mxy为两材料都 1 材料与方法 出现的带数。根据所得的遗传距离，用 UPGMA法