中国牛亚科家畜六个群体遗传多样性与遗传分化及统计方法研究.pdf

中国牛亚科家畜六个群体遗传多样性与遗传分化 及其统计方法的研究 摘 要 用中心产区典型群随机抽样采集中国牛亚科家畜四个牛种(普通牛(Bos taurus)、瘤牛(Bos indicua)、牦牛(Pbephagusgrunniens)、亚洲水牛(沼泽型， 口“施lus bubalis．swamptype))六个代表群体(鲁西黄牛、渤海黑牛、闽南黄牛、 青海牦牛、中国荷斯坦牛和山区水牛)共346个个体，用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE) 遗传多态性，利用不同的统计方法对结果进行分析。同时基于联合国粮农组织家 样性分析方法对20个中国黄牛品种进行了分析，结果如下： l、利用21个血液蛋白(酶)基因座所得结果，统计群体内及群体间遗传多样性， 传距离估计牛亚科家畜三个种属间的分化时间，结果表明：在所检测的21个血液 蛋白基因座中，共有13个基因座在六个牛群体中存在多态性：闽南黄牛群体内遗 传变异程度最高，13个多态基因座平均观测等位基因数、平均有效等位基因数、 牛群体内遗传变异最低，其平均观测等位基因数、平均有效等位基因数、平均杂 明显，54．5％的遗传变异来源于群体间，而45．5％的遗传变异是由于各群体内个体 间的差异引起的，鲁西黄牛、渤海黑牛、闽南黄牛和山区水牛群体内近交系数(Fis) (鲁西黄牛、渤海黑牛和闽南黄牛)与其它牛种(荷斯坦牛、牦牛和山区水牛) 相比，具有相对较近的亲缘关系，提示这三个地方黄牛品种具有相同或相近的起 源；家牛属与牦牛分化时间大约为1．4570百万年，与亚洲沼泽型水牛分化时间大 约为2．9475百万年，而牦牛与亚洲沼泽型水牛分化时间大约为5．4288百万年。 2、利用12个微卫星位点所得结果，估计群体内及群体间遗传多样性，利用6矿 和DA两种遗传距离构建系统发生树，并利用6，遗传距离估计牛亚科家畜三个种 属间的分化时间，结果表明：12对微卫星引物在六个牛群体中共检测到144个等 位基因和24个品种特有等位基因；品种特有等位基因数荷斯坦牛最多(10)，而 渤海黑牛和山区水牛最少(各为2个)；中国荷斯坦牛群体内遗传变异程度最高， 其平均观测等位基因数、平均有效等位基因数及平均杂合度分别为7．7500，4．9722 和O．7719，而山区水牛和牦牛均表现出较低的群体内遗传变异，平均杂合度分别 群体内近交系数为42．5％，六个牛群体间遗传分化明显，26．1％的遗传变异来源于 群体问，而73．1％遗传变异是由于各群体内个体间的差异引起的，每世代群体间有 不等。两种距离的聚类结果差异较小，鲁西黄牛与荷斯坦牛首先聚为一类，其次 才与渤海黑牛和闽南黄牛聚为一类，最后与牦牛和山区水牛；家牛属与牦牛分化 牦牛与亚洲沼泽型水牛分化时间大约为0．3272百万年。 3、综合和比较血液蛋白和微卫星数据，结果如下；利用六个群体13个多态 血液蛋白基因座和12对微卫星位点共25个标记的信息，连锁不平衡分析表明， 仅有渤海黑牛和牦牛处于连锁平衡状态，而其它四个群体处于连锁不平衡状态； 牛品种(鲁西黄牛、渤海黑牛和闽南黄牛)与其它牛群体(荷斯坦牛、牦牛和水 牛)相比，具有相对较近的亲缘关系。两类标记所揭示的六个牛群体遗传变异水 平、基因分化程度、聚类图和分化时间等方面均存在一定的差异：微卫星的观测 II 态信息含量为2．18到4．94倍，而由血液蛋白多态计算所得的基因分化系数为由微 卫星计算所得结果的2．1倍左右：由两类标记所构建聚类图的差异主要体现在渤海 黑牛的归属方面；由血液蛋白座位估计所得的牛亚科家畜三个种属间的分化时间 约为由为根据微卫星估计结果的6到16倍；微卫星用于牛亚科家畜不同种问遗传 多样性与遗传分化研究比血液蛋白多态具有明显的优越性，有三对引物 以上，说明这三对引物比其它引物更适用于中国牛亚科家畜遗传多样性及遗传分 化的研究。 4、 的影响，同时，比较了(掣)2和Dh两种遗传距离对群体遗传分化的估计，结果表 明：位点平均杂合度水平越高，系统树构建越准确，DA遗传距离系统树构建准确 性相对较高，但很难确定NJ法和UPGMA法哪一种更适合于系统树的构建，而 DrL遗传距离用于系统树构建有待进一步完善；DrL遗传距离在利用微卫星资料进 行家畜不同种属间分化时问估计时基本不可用，而由协矿遗传距离估计所得的分 化时间也应与其它资料(如线粒体、考古或历史文献等)所得结果相比较，才能 做出相对准确的判断。最后，对微卫星用于家