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RNA合成的化学机制与DNA依赖的DNA聚合酶催化DNA合成相似。 DNA聚合酶在启动DNA链延长时需要引物存在,而RNA聚合酶不需要引物就能直接启动RNA链的延长。 RNA聚合酶和DNA的特殊序列——启动子(promoter)结合后,就能启动RNA合成。 三、RNA聚合酶结合到DNA的启动子上起动转录 转录是不连续、分区段进行的。 每一转录区段可视为一个转录单位,称为操纵子(operon)。操纵子包括若干个结构基因及其上游(upstream)的调控序列。 调控序列中的启动子是RNA聚合酶结合模板DNA的部位,也是控制转录的关键部位。原核生物以RNA聚合酶全酶结合到DNA的启动子上而起动转录,其中由σ亚基辨认启动子,其他亚基相互配合。 对启动子的研究,常采用一种巧妙的方法即RNA聚合酶保护法。 E.coli的转录起始和延长 第一个磷酸二酯键生成后,σ亚基即从转录起始复合物上脱落,核心酶连同四磷酸二核苷酸,继续结合于DNA模板上,酶沿DNA链前移,进入延长阶段。 转录过程的电镜照片 依赖Rho 因子的转录终止 非依赖Rho因子的转录终止 ρ因子是由相同亚基组成的六聚体蛋白质,亚基分子量46kD。 ρ因子能结合RNA,又以对poly C的结合力最强。 ρ因子还有ATP酶活性和解螺旋酶(helicase)的活性。 目前认为,ρ因子终止转录的作用是:与RNA转录产物结合,结合后ρ因子和RNA聚合酶都可发生构象变化,从而使RNA聚合酶停顿,解螺旋酶的活性使DNA/RNA杂化双链拆离,利于产物从转录复合物中释放 。 真核生物具有3种不同的RNA聚合酶: 真核生物RNA聚合酶的结构比原核生物复杂,所有真核生物的RNA聚合酶都有两个不同的大亚基和十几个小亚基. RNA聚合酶Ⅱ由12个亚基组成,其最大的亚基称为RBP1。 RNA聚合酶Ⅱ最大亚基的羧基末端有一段共有序列(consensus sequence)为Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser的重复序列片段,称为羧基末端结构域(carboxyl-terminal domain, CTD)。 CTD对于维持细胞的活性是必需的。 二、转录起始需要启动子 、RNA聚合酶和转录因子的参与 (一)转录起始前的上游区段具有启动子核心序列 顺式作用元件:是指可影响自身基因表达活性的DNA序列。包括启动子、启动子上游元件(upstream promoter elements, or promoter-proximal elements)等近端调控元件和增强子(enhancer)等远隔序列。 起始点上游多数有共同的TATA序列,称为Hognest盒或TATA盒(TATA box)。通常认为这就是启动子的核心序列。 许多RNA聚合酶II识别的启动子具有保守的共有序列:位于转录起始点附近的起始子(intiator,Inr) 。 启动子上游元件是位于TATA盒上游的DNA序列,多在转录起始点约-40~-100nt的位置,比较常见的是GC盒和CAAT盒。 增强子是能够结合特异基因调节蛋白, 促进邻近或远隔特定基因表达的DNA序列。 RNA聚合酶II与启动子的结合、启动转录需要多种蛋白质因子的协同作用。通常包括:可诱导因子或上游因子与增强子或启动子上游元件的结合;通用转录因子在启动子处的组装;辅激活因子和/或中介子在通用转录因子/RNA聚合酶II复合物与可诱导因子、上游因子之间的辅助和中介作用。因子和因子之间互相辨认、结合,以准确地控制基因是否转录、何时转录。 真核生物转录生成的RNA分子是初级RNA转录物(primary RNA transcript),几乎所有的初级RNA转录物都要经过加工,才能成为具有功能的成熟的RNA。 加工主要在细胞核中进行。 帽子结构: 帽子结构的意义: 可以使mRNA免遭核酸酶的攻击; 也能与帽结合蛋白质复合体(cap-binding complex of protein)结合,并参与mRNA和核糖体的结合,启动蛋白质的生物合成。 尾部修饰是和转录终止同时进行的过程。 poly A的有无与长短,是维持mRNA作为翻译模板的活性,以及增加mRNA本身稳定性的因素。 一般真核生物在胞浆内出现的mRNA,其poly A长度为100至200个核苷酸之间,也有少数例外。 前体mRNA分子的断裂和加多聚腺苷酸尾是多步骤过程。 ? RNA编辑作用说明,基因的编码序列经过转录后加工,是可有多用途分化的,因此也称为分化加工(differential RNA processing)。 核酶的发现,对中心法则作了重要补充; 核酶的发现是对传统酶学的挑战; 利用核酶的结构设计合成人工核酶。 1.何谓转录(transcription)?需要哪些物质?转录有什么特点? 2
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