果蝇内含子和编码序列的信息参数D_2沿染色体分布.pdfVIP

第24卷第 5期 LU西大同大学学报f自然科学版) Vol24．0．5 20O8年 lO月 J0urnal0fShanxiDat0“gUnivelsity(Naturalscien【e) ()(t_2008 果蝇内含子和编码序列的信息参数D2沿染色体分布 解廷月 (山西大 同大学物理与 电子科学学院 山西大同 ()371【(19) 摘 要：本文以果蝇染色体的内含子和编码序列作为研究对象，用信息参数D!分析两类序列沿着染色体的分 布规律，并用多项式拟合分析染色体各类序列沿染色体的统计分布特征，分析 D 参数的平均值在不同的染色体 臂的分布特征． 关键词：果蝇染色体信息参数 内含予 编码序列 中图分类号：Q61 文献标识码：A 文章编号：l674—0874(2O08)05—002l一03 DNA是一种遗传语言，它由4个核f{=酸或碱基 规律取这种特殊形态 ．本文以染色体 内含子和编码 A『GcT(u)1组成．这其中包含了生命演化 、个体发育 、 序列为研究对象，并讨论果蝇序列沿染色体的分 基 的重组和表达、蛋 白质的进化 、以及生物大分 布，计算中所用的果蝇(D．mefnno r)序列来 自于 子的结构和功能的研究．物理学家在解释这些现象 文献 3【】． 的时候，他们首先沣意到的是核苷酸的统计关联．目 1 信息参量 前在 际物理杂志七已经发表 了不少这方面的文 章…．我们这里所说的核苷酸关联是指统计关联 ，而 核苷酸作为一种遗传语言，我们可以用信息论 不是指表达牛物功能的直接碱基耦合．由于统计关 的方法来研究它 并引入和信息熵 相联系的一 联是指那些统计 j二频繁 现的碱基关系，一般不具 阶信息冗余D．和二阶信息冗余D． 体涉及它们的功能，当然它们的频繁 现必是 自然 令序列中碱基 的 现概率为p ( A，c，G， 选择和中性突变的结果，冈而具有某种生物学涵义． T)，一对碱基 ，出现在相邻位点的联合概率为p， 从进化的方面来看，DNA序列是在随机突变、中性 1)u=pp 、 突变和 自然选择等联合作用下形成的，由于强大的 p为碱基 后出现碱基 的条件概率．引入信息熵 中性(即非选择有利也非选择有害)突变压力，它们 和随机序列靠的很近．DNA序列具有普遍存在的很 ： 一 ∑ gp (2) 强的紧邻碱基关联，这是遗传语言的重要特征．众所 和一阶信息冗余D， 周知，物种在进化中的形成和分岔是一个复杂过 程，在此过程中信息参数会随时间而变．但是一个 D：。一=2+∑pl。gp (3) 新物种一旦形成，其形态和基因结构就开始稳定下 D。用来描述序列中碱基分布相对于随机等概 来．所 以用今 日的序列资料进行分析，所得结果是 率分布的偏离．对于随机序列，D。=0引人马尔可夫 可以反映进化历程的．当然，南于进化的复杂性和 熵 (平衡条件熵)， 生物个体差异，信息参数的进化相关性只能在粗粒 化平均的意义上才能显示 来…．粗粒平均不是统 = 一 ∑p∑ l。gp (4) 计不足时的权宜之计 ，而是生物系统的复杂性要求 收稿 日期 ：2005一O5一l2 基金项 目：…西大同大学科学研究项 目2『(