DNA计算在两类特殊应用问题上及研究.pdf

DNA计并在两类特殊应用问题E的研究 摘‘要 问题的潜在解决方案之一，在理论上己成功的在多项式时间下解决了许多著名的 NP完全问题。DNA计算的特点使其在复杂的调度问题上有了新的解决方案，许多 复杂的调度问题均基于难解的NP完全数学问题，DNA计算的并行运算潜力为这些 调度问题提供了可能，倍受关注。另一方面，DNA计算模型尚不似传统计算机中 的通用，求解一个问题的DNA计算模型或算法通常很难不作修改地用于其它类似 问题的求解，因此，不管基于DNA计算的何种模型，目前几乎所有的基于DNA超 级计算的算法均使用完全穷举方式。这种方法的直接后果是DNA计算算法中呈纯 指数量级增长的DNA链数。随着DNA计算研究的逐渐深入，现有的基于穷举方法 的DNA计算算法中存在的解空间指数爆炸问题日益突出，已成为限制DNA超级计 算应用的瓶颈。因此考虑将传统电子计算机并行处理的策略、方法和技术引入 DNA超级计算是降低DNA链数的重要途径之一。 本文采用Chang等提出的DNA计算模型对于多处理机独立任务调度问题， 采用粘贴模型解空间及Adleman的生物操作集合，给出了一种新的该类问题的 DNA计算模型及相应的独立任务调度算法。 同时本文对如何减少DNA解空间问题做了一些尝试。从电子计算机中传统 并行计算和并行处理的模型出发，将传统并行处理的策略和DNA计算的特点相 结合，将电子计算机并行计算中的具有普适性的分治算法设计技术应用于求解子 集和问题的DNA计算中，提出一种求解子集和问题的质粒DNA算法，理论分析 表明：新算法在不提高算法的时间复杂度的前提下，可将求解子集和问题所需的 DNA链数从穷举算法的0(2疗)减少至0(2州2)。 关键词：DNA计算；任务调度问题；并行计算?分治法；NP完全问题；背包问 题 II Abstract anumberofuseful suchas The ofDNA affords properties ability computers anda makesDNA massi、，e hugememorycapacity，which computing parallelism NP andother ． b ofthe tosolvecomplete ,ecomes possibleways hard andwithout mosttask areNP hard，problems hand problems o，ne schedulingproblems another fromthe DNA hand，different corespondingparallelalgorithms．For traditionalthe traditional arelessuniversalthan ones，SO computers computers．DNA oraDNA forone