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双波长生物芯片荧光检测数据归一化方法研究.pdf
光电子·激光
V01.18No.6Jun.2007
第18卷第6期2007年6月 JournalofOptoelectronics·Laser
·图像与信息处理·
双波长生物芯片荧光检测数据归一化方法研究*
付东翔1’2一,陈家璧1,马军山1
(1.上海理工大学光学与电子信息学院,上海200093;2.上海理工大学计算机工程学院,上海200093)
摘要:基于总值归一化法,通过顺序形态变换实现双色荧光图像数据的校正,对双通道检测的2种不同波长的
Cy3、Cy5荧光图像进行了背景分析和归一化系数计算,数据分析显示双色荧光图像背景分割准确,依据其计算
双色荧光校正信号,能消除检测通道(PMT)等因素造成的差异。该方法也适用于多波长荧光数据归一化。
关键词:生物芯片;双波长;形态学;归一化
04
中图分类号:TP391文献标识码:A 文章编号:1005—0086(2007)06—0721
Normalizationof Huorescence
Two—wavelengthMicroarray Image
FU Jia-bil,MAJun-shanl
Dong-xian91’2一.CHEN
andElectronicsInformationInstituteof of forScienceand
(1.Optics UniversityShanghai Technology;2.Computer
Instituteof of forScienceand 200093,China)
Engineering UniversityShanghai Technology
Al粥tract:Thedifferencesin andexcited betweentWOfluorescent and
effidency energy dyes(Cy3,Cy5),gainsay—
labeling
namic betweenredand channelsinthe variationin
result dual—wavdengthscanning.A
range green systematic micmarray
is aIe
normalizationmethodwithorder filter estimationsofeachspot doneby
morphologypresented.Thebackground per—
centile afterfluorescent whichis minimum resultshowsthattheratio
filtering micoarraygridding employedby filtering.The
oftwo-colorfluorescentcouldbecorrected
intensity appropriately.
Keywords:microarray;dual-wavelength;mo
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