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362 质谱学报 第31卷增刊
质谱法探测DNA特殊二级结构、性质、特异识别
和分析方法的研究
袁谷，周 江，郑波
(北京大学化学学院化学生物学系，生物有机与分子工程教育部重点实验室，北京分子科学国家实验室，北京100871)
of DNA
ProbingSpecific
and ESI—MS
Recognitionby
YUAN Bo
Gu,ZHOU
Jiang,ZHENG
Molecular
(BeijingNationalLaboratoryforSciences,Dqx删m,mtofChemicalBiology,
CollegeofChemistry,Peking100871，China)
Univ鼎sity,Beijing
Abstract：Theand were for DNA
annealingpolyamide-reeognitionswategiespresenteddis曲毋dsbinghairpm
fromcoil ESI-MS．Andmass wasusedto DNA‰mismatchDNA．For
DNAby spectrometryrecognizeduplex
and G-rich structureswere the
Stat3，Rlxc-mye sequencesadoptG-quadmplex ot蝽erved,and
genes，the directly
non-covalentinteractionofthe andsmallmoleculeswas ESI-MS．
G-quadmplexes mvesfigaaxlusing
Keywor凼：ESI·MS；G诎uplexDNA；recognition
中图分类号：0657．63 文献标识码：A 文章编号：1004．2997(2010)增刊-0362-02
DNA的特殊二级结构，例如发卡和G．四链体，在基因的调控，癌症的发生等生命过程中起非常
重要的作用，已成为抗癌药物设计的新靶点。
近年来我们的注意力聚焦在电喷雾质谱法(ESI．MS)研究DNA特殊二级结构、性质及识别方
法的研究，探测了若干与重大疾病相关的G．四链体的结构、性质和特异性识别【l。51。例如，在以Bcl-2
癌基因富G序列为靶点的研究中，使用ESI．MS方法研究了其G一四链体的形成和性质，发展了
ESI-MS研究识别分子与HIV-1DNA非共价相互作用的分析方法，发现了对HIV-1DNA具有强亲合
力的新型识别分子。
本工作使用ESI-MS研究若干发卡型和新颖G-四链体DNA的形成、结构、性质和特异性识别，
发展DNA识别质谱分析方法。
1)本研究首先选择乙型肝炎病毒发卡DNA为靶点，利用ESI-MS方法研究发卡结构与其对应
无规线团DNA的性质差异，提出了使用互补链共退火．ESI质谱法区别发卡DNA和无规线团DNA
的新方法。
’2)选用与HIV-1DNA相关、能形成发卡结构的序列H4，使用ESI—MS研究stem区长度和碱
CG碱基含量越高，发卡结构越稳定。发现Pl和P2寡聚酰胺分子对于发卡序列具有很强的亲和力
和好的序列选择性。
基金项目：血管内皮生长因子基因启动子区G．四链体的性
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