DNA—喜树碱复合物的NMR的研究.pdfVIP

El-02 DNA一喜树碱复合物的NMR研究 张友杰陈嵘阎江丽 别，对埔复合物的可能构象进行了讨论． 关键词：Dn～药物复合物；DNA；喜树碱；删R 从80年代后期到90年代，有些学者应用N她二雏谱方法研究了药物一DNA的相互作用“。。但这些 莲属植物喜树的种籽或树皮中提出的一种生物碱。它对多种肿瘤都具有抗癌活性，可以抑制I)NA和RNA 离约束分子动力学方法研究了该复合物在溶液中的可能构象． 实验部分 m d(GGTATACC)：样品由上海细胞研究所合成并纯化，制成约0．5mol／L浓度的重水溶液。喜 树碱粗品购自黄石第三制药厂，经多次重结晶纯化后得淡黄色针状晶体。 0．tK)，采用Bruker标准脉冲序列，用预饱和法压制水峰，TPPI方式采样． 结构计算采用距离约束分子动力学方法，在Indigo工作站上完成。计算程序为SYBYL6．1软件 包中分子动力学模块．质子间距离的半定量计算用Fortran 77自编程序完成。 结果与讨论 首先我们通过串行或顺序路径(Sequential Walk)法归属了DNA及其与喜树碱的复台物中非交 换质子，并确定了它们的化学位移。某些质子的化学位移及质子间距离的变化见表l所示。 (cc)碱基对之间，从而形成了分子复合物，即夹嵌物(intercalator)，见圈1． Table1．Main Some C=h．他¨of$paoeDin·rm·(r．㈣ofProtona between and d(G盯^T加c)2-Cmptothecin d(∞T^T^∞)2 Complex H(i) G1，I 啦I T3M 6 G6 Ct6 CaI G28 H(i) G1z Gl，I·G工8 Ctl， Ct? c7l- Glr G1．r 5(i) 7．78 7．72 1．35 7．48 7．48 725 7．78 7．72 6m 2．51 5．64 7．72 5．38 1．98 5．s3 2．6l 2．6l 0．380 0,325 0．391 r(6×复合物)0．287 0．3610．378 0．339 0282 “i基型型 !：箜!． !：!!! 竺!丝 !：i丝 !：!!! !：!丝 !：!!! !：!竺 129 and Schemofinteraotionbetweend(C．羚TATACC)2Oamptotheoin 1 Strtmture Fig 参考文献 0993)． [1]M 5，Part5，403—480 S．Searle，Prog．NMR3pectros，2 32—644(1971) InteraotionbetweenOI