几种模式生物的基因打靶的研究概述.pdfVIP

摄建霆n 第三届海洋生物高技术抡坛 2005．08．19-23 几种模式生物的基因打靶研究概述 熊茜+吴玉萍张广献罗芳崔彩媚禹艳红徐安龙术 0275 中山大学生命科学学院，国家863计划海洋生物功能基因组开放实验室，广州，51 摘要：模式生物基因组计划是人类基因组计划的一个重要组成部分，是人类基因组计划 (human project，HGP)的必要补充并对其研究有很大的促进作用。在模式生物中的基 genome 因打靶研究更是后基因组时代基因功能研究的重中之重。目前，在小鼠中已有了成熟的基因 打靶系统，同时在其他模式生物果蝇、拟南芥和斑马鱼中也在进行基因打靶技术研究工作。 这方面的研究工作不仅可以推动基因组研究方法和技术的发展，为人类基因组计划提供理想 的实验系统，而且在生物信息学领域、人类疾病(特别是多基因遗传性疾病)的预防、诊断、 治疗、新药的开发以及自身研究成果(如植物基因纽计划)的应用等方面也有广阔的应用前 景。 关键词：基因打靶，模式生物基因组计划，进展 l模式生物基因组计划 模式生物基因组计划是人类基因组计划(human project，HGP)的～个重要组 genome 成部分，是人类基因组计划的必要补充并对其研究有很大的促进作用。目前从模式生物基因 组研究中得出了一些规律：模式生物基因组一般比较小，但编码基因的比例较高，重复顺序 和非编码／ll页)-Y-较少；其G+C％比较高：内含子和外显子的结构组织比较保守，剪切位点在多 种生物中一致：DNA冗余；绝大多数的核心生物功能由相当数量的orthologous蛋白承担； Synteny连锁的同源基因在不同的基因组中有相同的连锁关系等(吴学军，2000)。模式生物 基因组研究可以帮助揭示人类基因的功能；利用基IN／II哽序上的同源性克隆人类疾病基因，利 用模式生物实验系统上的优越性，在人类基因组研究中的应用比较作图分析复杂性状，加深 对基闪组结构的认识(李伟，2000)。 模式生物基因组计划最初确定的模式生物有：大肠杆菌、酵母、拟南芥、线虫、果蝇和 小鼠等共六种，对这些处于生物演化不同阶段的生物体的研究是认识人基闵组结构和功能绝 对不可缺少的，在后来的发展中逐渐加入了其它一些模式生物种类，如河豚鱼、斑马鱼等。 此外，一些具有重要生产价值的农作物，如水稻基因组；与人类健康密切相关的动物，如恶 性疗原虫基因组等I’内研究也加入到模式生物基因组计划中来。随着人类基因组计划的不断深 入，将会有越来越多的模式生物体加入到模式生物基因组计划中来n1。 国际人类基因组计划已全面展开对各种模式生物全基因组测序工作。目前，酵母、线虫、 小鼠、果蝇、拟南芥等经典模式生物的基因组序列测序都已100％完成，而斑马鱼，河豚鱼 资助课题：国家“863”计划项目(编号：2004AA626080)、国家自然科学基金(编号。 +通讯作者Email：ls36@zsu．edu．cn，Tel：020 710 覆建覆仃 第三届海洋生物高技术地坛 2005．08．19-23 等特种生物的基因组测序也接近尾声。面对海量的数据，单单用现时的生物信息学手段分析 是远远不够的；而以前所应用的传统的从基因到功能的研究更加不适用于大规模的基因功能 研究。从基因到功能的反向遗传学研究手段已成为后基因组时代的研究主流。以突变目的基 因功能为主要目的的基因敲除技术大展拳脚。因此在各种模式生物中开发建立基因敲除技术 势在必行。本文对几种模式生物中现有的基因打靶技术予以综述。 2基因打靶概述 正常基因突变体的研究将大大加快该基因功能的研究。比如动物个体整个发育进程研 究可以通过一系列的基因突变导致的功能缺失的异常发育表型来进行。基因敲除中使用最广 泛的就是基因打靶技术。基因打靶(genetargeting)，一种通过同源重组按预期方式改变生物活 体的基因组遗传信息的技术，是后基因组时代研究基因功能最直接和最有效的方法。这项技 术在繁多生物数据的基础上为功能基因组学的研究构建了一个四维空间；在活体