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第9卷第4期 生物信息学 V01．9No．4
201 China ofBioinformatics
1年12月 Journal Dec．，2011
doi：10．3969／j．issn．1672—5565．2011．04．13
甘蔗几丁质酶基因的电子克隆与生物信息学分析
苏亚春，李国印，阙友雄，郭晋隆，徐景升，许莉萍’
。
(福建农林大学农业部甘蔗遗传改良重点开放实验室，福建福州350002)
摘要：用电子克隆方法获得甘蔗几丁质酶基因SCCHll，采用生物信息学方法，对该基因编码蛋白从氨基酸组成、理化性质、
236
跨膜结构域、疏水性／亲水性、亚细胞定位、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明：SCCHtl基因全长l
bp，包含一个完整的990
化区，与高粱等其它植物的几丁质酶基因具有高度的相似性。为SCCHll基因的分子克隆、功能鉴定和应用提供参考。
关键词：甘蔗；几丁质酶基因；电子克隆；生物信息学
中图分类号：Q785文献标识码：A 文章编号：1672—5565(2011)一04—322—06
Insilico andcharacterizationchitinasefrom
cloning of gene
bioinformaticstools
．sugarcaneusing
SU
Ya—chun，LI
Guo—yin，QUEYou—xiong，GUOJin—long，XUJing—sheng，XULi—ping’
Genetic
(研Laboratory矿Sugarcanelmprotmnent，Minutry矿Agriculture，FujianAgriculture＆fomtry
Umven缸y，Fu．小ou脚，Ch／na)
novelchitinaseSCCHllfrom clonedinsilicobasedon
Abstract：A gene sugarcane(Saccharumofficinarum)was
the EST inNCBIdatabase．SomecharactersofaminoacidsencodedSCCHll
correspondingsugarcanesequences by
the ofamino
acid andchemical do·
gene，includingcomposition sequence，physical
and structureof the
localization，secondarytertiary protein
main，hydrophobicity／hydrophilicity，subcellular plus
functional
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