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碱裂解法快速提取中药炒制品DNA的研究
[摘要]该文旨在探索一种适用于中药炒制品DNA快速提取的方法。以氢氧化钠,1% PVP40和1% TritonX-100配制成碱裂解缓冲液,Tris-HCl为中和液,经加热裂解和中和2步提取不同炒制方法制备的中药炮制品的DNA,选择2种方法对DNA进行纯化,并以纯化后DNA作为模板利用通用引物进行PCR扩增。结果表明优化碱裂解法可简单快速的提取出药材DNA,槐米炒制品DNA质量浓度为(420.61±123.91) g?L-1,且使用5% Chelex-100树脂纯化可以提高DNA提取浓度。研究结果证明优化碱裂解法适用于中药炒制品的DNA快速提取。
[关键词]中药炒制品;DNA快速提取;碱裂解法;Chelex-100
多数中药材必须经过炮制方能入药[1],加热是中药材炮制最重要的手段之一,其中最常用的方法是炒制和煅制。炒制不仅会改变动植物药材的化学成分,也会改变其DNA状态,造成药材DNA降解[2],使得DNA提取难度增大,影响中药分子鉴别方法的使用。如何从中药炮制品中简单、快速的提取DNA是一个亟待解决的问题。研究者先后报道了CTAB法[3]、高盐低pH法[2]等,但这些方法耗时长,且需使用多种有机试剂,难以满足中药分子鉴别技术快速、简单、安全低毒的要求。
碱性裂解法能够使样本在强碱性及高温下迅速破坏细胞膜及核膜,使DNA释放。此方法与传统的CTAB法相比,具有操作简单,耗时短,无需使用氯仿、异戊醇等有机试剂,对人体无毒害作用等优点,已被广泛应用于动物[4]、植物[5-7]、微生物[8-9]。蒋超等[10]报道了基于碱裂解法的中药材快速DNA提取方法,即以氢氧化钠、PVP40和TritonX-100配制成碱裂解缓冲液,Tris-HCl为中和液,经加热裂解和中和两步操作,即可获得高质量的中药材DNA,但使用该配方进行中药炮制品DNA提取,其DNA质量有所下降。
本文以槐米炒制品为研究对象,对上述中药材快速DNA提取方法进行了改良,引入DNA快速纯化步骤,在10 min左右即可获得高质量的DNA,能满足PCR扩增及测序的要求。该方法同样适用于醋炙延胡索、酒炙当归、盐炙补骨脂、麸炒苍术等辅料炒制药材的DNA提取。
1 材料
1.1 仪器试剂 漩涡振荡器(Scientific industrial公司);离心机(Eppendorf公司,型号 5810R);PCR仪(ABI公司,型号 7500);电泳系统(北京市六一仪器厂);紫外凝胶成像分析仪( Syngene公司) 。
氢氧化钠(北京化工厂),PVP40( 聚乙烯吡咯烷酮40,北京江晨生物科技有限公司);TritonX-100(曲拉通100,北京江晨生物科技有限公司);rTaq DNA聚合酶(Takara公司);琼脂糖(Invitrogen公司);Tris(三羟甲基氨基甲烷,Takar 公司);NaAc(醋酸钠,北京化工厂)。EasyPure Quick Gel Extraction Kit(北京全式金生物科技有限公司),ChelexTM100 sodium form (Sigma公司)。
1.2 中药生品 槐米、延胡索、苍术生品购自河北省安国中药材市场,当归、补骨脂生品购自广西玉林中药材专业市场,按照《中国药典》2010年版一部鉴定,均符合要求。
1.3 槐米清炒品制备 分别取槐米生品,在不同温度下,经炒制不同时间,共制备28组样品,最低炒制温度为120 ℃,每升温10 ℃为1个温度处理,直至升温到250 ℃,共14个温度处理;每个温度处理分别炒制30,60 min 2组样品。
1.4 辅料炒制品制备 分别取延胡索、当归、补骨脂、苍术生品,按照《中国药典》2010年版一部,附录ⅡD炮制通则项下要求,制备醋炙延胡索、酒炙当归、盐炙补骨脂、麸炒苍术。凭证标本保存于中国中医科学院中药资源中心。
2 方法
2.1 碱裂解法[10] 称取药材粉末20 mg,加入200 μL裂解液(不同浓度NaOH,1%PVP,1% Triton-100),使用漩涡振荡器振荡10~15 s混匀;煮沸10~15 s,取出;加中和液(0.1 mol?L-1Tris-HCl,pH 8.0)800 μL,涡旋混匀,12 000 r?min-1离心5 min,取上清。
2.2 DNA纯化 Chelex-100[11]纯化:取上清50 μL,加入等量悬浮好的10%Chelex-100溶液,使用漩涡振荡器振荡10~15 s混匀,12 000 r?min-1离心5 min,取上清进行PCR反应。EasyPure Quick Gel Extraction Kit试剂盒纯化:取上清100 μL,按其说明书操
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