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中国特有小型猪中内源性反转录病毒的大规模筛查
马玉媛吕茂民章金刚’
【摘要】本研究对中国特有小型猪七个猪种中猪内源性反转录病毒(PERV)的存在与表达状况
进行了大规模筛查。根据目前通用的囊膜基因分型方法设计.了型特异性引物,利用PCR方法进行分型检
测。此外,对五指山猪、巴马小型猪中该病毒的核心蛋白基因(gag)、多聚酶基因(p01)及囊膜基因
(el/V)的存在与表达状况也进行了检测。结果表明,348份被检基因组DNA样品中均有PERV的存在,
表达。本研究获得了国内PERV的分子流行病学的详细资料。研究结果还表明可以通过选择育种来培育
c亚型存在的猪种。
PERv低负荷尤其是无PERV
【关键词】猪内源性反转录病毒;中国小型猪;异种移植
猪作为异种移植的最佳供体已经得到科学界的一致认可:然而人类却因此面临感染猪内源性反转录
endogenous
病毒(porcine
细胞系和其他一些物种,而PERv-C除能感染一种人源细胞系外其感染性主要局限于猪细胞系12’4】。
中国特有小型猪遗传背景清晰,个体间仅存在微小差异【5】,因此可望成为异种移植的良好供体。目
前,国内尚缺乏小型猪中PERV分子流行病学的充分资料,为此,我们开展了对小型猪中PERV存在与表
达状况的大规模筛查,这对进一步开发利用和保护这些良种资源具有重要意义,也为进一步研究PERV
与异种移植的安全性打下了基础。
1.材料与方法
1.1材料
1.1.1检测样品共采集五指山猪、巴马小型猪、中国实验小型猪、贵州小型猪、剑河香猪、巴马
香猪及版纳小型猪7个猪种共348份外周血样品。
Marker
DNA聚合酶、DNADL2000等购自TaI出a生物工
公司;TRIzol试剂为Invitrogen公司产品;rTaq
程公司。
1.2外周血淋巴细胞的分离 自小型猪前腔静脉采集EDTA抗凝血,采用淋巴细胞分离液分离得到
外周血淋巴细胞(PBLo利用Trizol试剂制备PBL总RNA。
1.3PBL
【基金项目】十五国家科技攻关重点项目(2004BA717B·02-04):国家自然科学基金;
北京市自然科学基金(5032015)资助项目
+【通讯作者】章金刚,Tel/Fax:010E·maii:zhangig@nic.bmi.ac.ca
r
70。C备用。
1.4引物的设计与合成
根据已发表的PERV核苷酸序列,设计并合成了三对引物分别用于检NPZRV
gag、pol、已n1,基因,
体序列见表1:
表1PERV存在检测引物与分型引物
引物名称 核苷酸序列(5’-3’) ,PCR产物长度
1.5PCR扩增与分析
buffer
.PCR反应在209L体系中进行,取100ngPBL的基因组DNA作模板,依次加人10×PCR
2/.tL,
1 0mmol/L
dNTP混合物2儿,上、下游引物各20pmol,rTaq
DNA聚合酶1.2U,加无菌去离子水!i5209L。
检测PERV
oC45s.72。C
序为:92C变性4min;94。C30s一53
MarkerDL
退火温度由53℃改为58。C,其余皆和A、B型相同【41。在扩增结束后取PCR产物109L与DNA
和281bp。取PKl5细胞的
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