青藏铁路沿线唐古拉山口土壤微生物的ARDRA分析.pdfVIP

第 28卷第 11期 生 态 学 报 V01．28．No．11 2008年 11月 ACTA ECOL0GICA SINICA Nov．．20o8 青藏铁路沿线唐古拉山口土壤微生物的ARDRA分析 李潞滨 ，刘振静 ，杨 凯 ’，刘 敏。，周金星 ，孙 磊 ，韩继刚 (1．中国林业科学研究院林业研究所，国家林业局林木培育重点实验室，北京 100091； 2．北京农学院，农业应用新技术北京市重点实验室，jE京 102206；3．河北大学，河北省生物工程技术研究中心，保定 071002) 摘要：通过构建 16SrDNA文库及文库的限制性片段长度多态性分析(ARDRA)，对青藏铁路沿线唐古拉山口的土壤微生物多样 性进行了研究。采用限制性内切酶HaeIII和RsaI对克隆文库 中的90个克隆子进行了酶切分型，根据 ARDRA酶切图谱的不 同，可将其分为23个OTUs。16SrDNA序列分析结果表明，该克隆文库中主要包括变形菌门(Proteobacteria)的alpha、beta、detla 亚类、厚壁菌门 (Firmicutes)、放线菌 门(Actinobacteria)、拟杆菌门 (Bacteroidetes)、酸杆菌 门(Acidobacteria)及浮霉菌 门 (Planctomycetes)等8类细菌及未培养细菌。Alpha变形细菌为该文库中的主要菌群，占克隆总数的33．3％；其次为未培养细 菌，占克隆总数的22．2％，Bradyrhizobium为优势菌属。研究结果揭示，青藏铁路唐古拉山口的土壤微生物种群不仅具有丰富的 多样性，还存在丰富的潜在新菌种。 关键词：青藏铁路 ；唐古拉山口；微生物；多样性；ARDRA 文章编号：1000—0933(2008)11．5482．06 中图分类号：Q143 文献标识码 ：A SoilmicrobialARDRA analysisofTanggulaMountainPassalongtheQinghai- Tibetrailway LILu—Bin ，LIUZhen．Jing，YANGKai ，LIU Min ，ZHOUJin—Xing，SUN Lei，HANJi—Gang 1ResearchInstituteofForestry，ChineseAcademyofForestry，KeyLaboratoryofTreeBreedingaM Cultivation，StateForestryAdministration，Bejiing 100091，China 2BeijingKeyLaboratoryofNewTechnologyinAgriculturalApplication，BejiingUniversityofAgriculture，Bering 102206，China 3ResearchCentreofBiologcialEngineeringforHebeiProvince，HebeiUniversity，Baoding071002，China ActaEco 口Sinica，2008，28(11)：5482—5487． Abstract：ThesoilmicrobialdiversityofTanggulaMountainPassalongtheQinghai—Tibetrailwaywasanalyzedby16S rDNAcloning，amplifiedribosomalDNArestrictionanalysis(ARDRA)，andsequencehomologycomparisons．Among90 positiveclonesinthe16SrDNAlibraryofmicroorganisms，23OTUs(OperationalTaxonomicUnits)wereidentifiedbased onthesimilarityoftheARDRA bandingprofiles．Sequenceanalysisrevealeddiversephylaofbacteriainthe 16SrDNA library，whichconsistedofalpha，beta，deltasubclassesoftheProteobaeteria，Fi