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松墨天牛肌钙蛋白T基因全长cDNA克隆及分析.pdf
福建农林大学学报 (自然科学版) 第44卷第 1期
JournalofFujianAgricultureandForestryUniversity(NaturalScienceEdition) 2015年 1月
松墨天牛肌钙蛋白T基因全长 cDNA克隆及分析
吴华俊,许 雯,林 同
(华南农业大学林学院,广东广州 510642)
摘要:采用 cDNA末端快速扩增 (RACE)方法获得 了松墨天牛 (Monocham~ 口fm )肌钙蛋白T基因eDNA,全长 1531
bp,命名为MaTnT(GenBank:KJ756400).该基因开放阅读框 (OaF)为 1020bp,编码339个氨基酸,等电点为9.26,推测的编
码蛋白质分子质量为37.29ku.同源比对结果表明:MaTnT与褐飞虱 (Na/w~ alugens)、黑腹果蝇 (Drosophilamealno-
gaster)等 12种昆虫肌钙蛋白氨基酸同源性为87%一88%;构建的系统发育树显示 MaTnT处于独立分支;MaTnT没有信号
肽和跨膜螺旋,属于亲水性氨基酸,二级结构包含了螺旋和不规则卷曲两种形式,含有丝氨酸(Set)、苏氨酸(The)、酪氨酸
(I )磷酸化位点数分别为8、9.3个.RT—qPCR检测表明,MaTnT基 因在幼虫、蛹和成虫中均有表达;在成虫触角和足中表
达量最高.
关键词:松墨天牛;肌钙蛋白;基因克隆;RT—qPCR
中图分类号:Q966 文献标识码:A 文章编号:1671~470(2015)01-0058-06
Cloningandcharacterizationoffull-lengthcDNA sequenceoftroponin
T genefrom Monochamusalternatus
WUHua-jun,XUWen,LINTong
(CoHegeofForestry,SouthChinaAgriculturalUniversiyt,Guangzhou,Guangdong510642,China)
Abstract:AfulllengtIlsequencetroponinTgenewasclonedfromMonochamusalternatusbyRACE(rapid-amplificationofcDNA
ends)method,designatedasMaTnT(GenBank:KJ756400).Thefull—lengthcDNAofMaTnTWas 1531bp,whichcontmnod a
1020bpopenreadingfrmae(ORF)encoding339amino d8withacalculatedmolecularmassof37.29kuandanisoelectricpoint
0f9.26.Bioinformaticnaalysisshowedthat theMaTnTproteinWas hydrophilic.withouthtesingalpeptideandtransmembranehell-
ees;nadhadhJshaminoacidsequencehomologywihthtetroponinsin12insectssuch鹊 lugensandDrosophilamealno-
gaster(87%一88%).PhylogenetictreeindicatedMaTnTWaS inallindependentbrnach.Thesecondarystructurepredicationof
MaTnTwas comprisedofhelixesnadcoils.Th ere were 8,9nad3 serine,threoninenadp-hydroxyphenylalaninephosphorylation
sites,respectivelyamongMaTnT.RT—qPCR detcetionshowedthatMaTnT geneWas expressed inlarvae,pupaeandadults,nad
reachedthehisheat exp
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