miR15a靶基因的预测与生物信息学分析.pdfVIP

生 物 技 Vol． 21 ． 179 SRZlYELN一．…犟GD良膏术 NOLOGYNo．2一一Mar．，2…010一， INBIOTECH doi：10．3969／j．issn．1009-0002．2010．02．008 研究报告 miR一15a靶基因的预测及生物信息学分析 张菁1-一，邹淑雪3，张茂林2，关振宏2，段铭2 1．湖南农业大学动物医学院，湖南长沙410128；2．人兽共患病研究教育部重点实验室，吉林大学人兽共患病 研究所，吉林长春130062；3．吉林大学计算机科学与技术学院，吉林长春130012 [摘要】 目的：对目前研究较为广泛的miR一15a的靶基因进行预测及相关生物信息学分析，以期为lIliR一15a靶基因 的实验验证提供数据支持，并为深入研究miR一15a的调控机制及生物学功能奠定基础和提供理论指导。方法：选择 Targetscan5．1与HcTar两种计算方法预测miR一15a的靶基因的交集作为分析的基因集合，分别进行GO注释描 述、G0富集分析和生物通路富集分析。结果与结论：预测靶基因集合分别富集在转录调控、蛋白质修饰、细胞周期等 中的Wnt信号通路、细胞周期和p53信号通路等5个信号转导通路及前列腺癌、慢性髓细胞性白血病、黑素瘤等7 个疾病通路中(P0．05)。 【关键词】miRNA；靶基因；生物信患学 【中图分类号】Q811．4 【文献标识码】A 【文章编号】1009-0002(2010)02—0179-05 BioinformaticsandPredictionofmiR-15aGenes Analysis Target ZHA NG N N NG斯菅。，ZOUShu-Xue3,ZHAMao-Lin2,GUAZhen-Hon矿,DUAM讥菅 of of VeterinaryMedicine，Hunan LaboratoryZoonoses， 1．College AgriculturalUniversity，Cb彻gsba410128；2．Key of of of Science MinistryEducation，InstituteZoonoses，JilinUniversity，Changchun130062；3．CofiegeComputer and Technology，JilinUniversity，Changchun130012；China bioinformaticssoftwareand to and 【Abstract】Objective：The database唧appliedpredictanalyzetargetgenes of orderto foundationand theoreticalbasisfor 5．1and miR-15a,inhy provide PicTar wereusedto of theintersectionofthetwo set target miR-15a,and algorithm predict genes results鹅gene GO and annotation。GO 哪analyzedby