中国荷斯坦牛基因组选择方案经济评估.pdfVIP

统计遗传学、数量遗传学和生物信息学 中国荷斯坦牛基因组选择方案的经济评估 陈军，王雅春，孙东晓，张毅，俞英，张沅掌 中国农业大学动物科技学院，北京100193 关键词：中国荷斯坦牛；基因组选择育种方案；后裔测定育种方案；青年公牛育种方案；经济评估 引言 传统的奶牛群体遗传改良方法，即以公牛后裔测定为核心的人工授精(AI)育种体系，其缺点主要是世 代间隔长，育种成本高。近年来，由于家畜基因组测序技术、基因芯片技术的不断发展，Meuwissen等提出 了“基因组选择(GS)法”，GS是利用覆盖在全基因组上大量的SNP信息，估计覆盖整个基因组上所有的有效 此可大大缩短世代间隔，且种公牛各性状育种值估计的准确性一般可达到0．7以上。本研究通过比较基因组选 择育种方案、后裔公牛育种方案、青年公牛育种方案，探讨在中国荷斯坦牛群中构建基因组选择育种方案的 效率，并对影响基冈组选择方案效率的备冈素进行深入分析，为优化基因组选择方案提供依据。 材料与方法 记检测，并估计全基因组的SNP效应，构建基冈组育种值估计系统；设定群体规模是100000头成母牛，在 育种核心群中，通过传统遗传评定方法，初选200头优秀母牛，再通过基因组检测，选出具有最高GEBV的 100头母牛作为公牛母亲，与最优秀的公牛冻精交配，以获得50头公犊牛，公犊牛出生后，即可进行基因组 SNP检测，并选留其中GEBV最高的5头公牛进入公牛站，在青年公牛12月龄后即可开始生产精液并在全 群中推广。本研究设定整个规划投资期为20年，使用ZPLAN程序，其基本原理为选择指数法和基因流动法， 通过对该软件中子程序NBILD和NUMBER的调试，可以构建不同畜种的育种方案。 结果与讨论 基因组选择方案中，平均世代间隔为3．036年，比后裔公牛测定育种方案和青年公牛育种方案分别缩短了 选择方案较公牛后裔测定方案几乎降低了一半。同时可以加快奶牛功能性状的遗传进展。在基因组选择方案 中，每年参加基因组检测的后备公牛头数不变时，当增加选留公牛的头数，育种效益也随之下降。选择准确 性与群体遗传进展问呈正相关，随着公牛选择准确性的提高，在育种投入不增加时，育种产出和育种效益呈 提高的趋势。随着基因组检测成本的提高，育种投入呈上升趋势，但并不改变育种产出，因此育种效益呈下 降趋势。 基因组选择育种方案可以简化选育公牛的过程，缩短公牛、母牛选择通径的世代间隔，从而也缩短了育 种核心群的平均世代间隔。因此，在上述三个育种方案的育种成效比较分析中，基因组选择育种方案预期可 实现的遗传进展优于其它两个方案；通过经济学分析表明，基因组选择方案的育种投入低于后裔测定方案， 而育种产出高于后裔测定方案，进而预期可获得的育种效益更为理想。本研究结果还证实了，通过基因组选 择可以加快奶牛功能性状的遗传进展；而奶牛功能性状，诸如抗病力、长寿性、繁殖力等，均对奶牛生产有 着十分重要经济意义。本研究采用家畜育种规划最优化方法，研究了影响奶牛基因组选择方案育种成效的主 要因素，为构建和实施一个在公牛的选择强度、公牛选择的准确性和基因组SNP检测成本三因素优化组合的 基因组选择育种方案提出了科学的依据。 致谢 (D08060500070801)，863项目(2007AAIOZl57)资助。 一53—