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面向低碳经济的工业微生物菌种的改造方法研究 邢新会 清华大学化工系生物化工研究所 Email：xhxing@tsinghua．edu．cn 生物产业的发展是实现低碳经济的重要支撑体系。菌株是生物产业发展的重要 研究对象，是工业生物技术特别是新一代工业生物技术发展的核心内容。一个好 的菌株，可以形成和发展出一个产业：现代工业生物技术和生物产业的发展，需 要不断的发现和创制新的、性能更优越的工业微生物菌种。 用作工业菌株的微生物，其来源通常主要有两个途径：从自然样本中通过筛选 与分离获得(即选种)；在已有微生物菌株进行遗传改良获得(即育种)。选种是 获得工业菌种的基础，是目前获得生物产业用菌株的重要方式；育种是获得性能 优良的工业菌种的必要改造手段，是目前改造工业菌株的主要途径。 目前，工业上使用的许多生产菌株是通过各类诱变加速基因突变过程及定向筛 选而获得的。重组菌株(recombinantstrain)是通过基因重组技术对菌种进行 “定向遗传改良获得的，所使用的技术包括杂交、原生质体融合、基因工程、 代谢工程等。通过基因工程方法获得的菌株属于“遗传修饰生物体”(genetic modification organisms，GMO，经外援基因导入并因此发生遗传整合和形状改 变的生物体)。目前，和基因工程菌相比，诱变菌株、杂交菌株被认为是非GMO， 能够用于GMO菌种不能或不允许使用的生物技术领域。 基因重组育种和重组DNA技术作为分子生物学的重要组成部分，在近几十年得 到了长足的发展，其通过这两种方法获得的优良的菌株也逐渐增多。但是也面临 一些新的挑战：这些操作方法本身成本相对较高，需要专业的技术人员进行，因 而无法在工厂的日常生产中直接进行操作；目前成功的方法基本都是针对基因序 列清楚的工业微生物，然而面对基因组较大、代谢和调控网络复杂的微生物，成 功的例子不多；通过重组I)NA技术获得的菌种，尤其是通过质粒携带基因的工程 菌，在生产中经过传代培养后常常出现外源基因丢失的等情况。另外，传统的诱 变育种手段都因其自身的特点和缺陷，存在着应用的局限性。 但无论是对生物产业，还是对现代生物技术的发展，发展方便、快速、高效的 基因组突变方法依然占有重要的地位。同时，基因组突变方法与系统生物学及合 成生物学的结合，将为功能理想的”超级微生物菌种的构建提供可能。因此， 研究新型的微生物基因组突变方法，并进一步和现代分子生物学手段相结合，进 行微生物菌株育种方法的研究具有重要的应用价值和学术意义。 对基因组、代谢网络和调控网络的系统认识是系统生物学及合成生物学技术构 建高效工业微生物的关键。为此，需要开发构建多样性大的基因组突变库的新方 法。本报告将介绍微生物代谢和调控网络改造的最新研究进展，包括现代生物技 andRoom 术的应用及常压室温等离子体(AtmosphericTemperaturePlasma，ARTP) 快速突变微生物基因组的新方法的开发。ARTP具有射流温度低、无需真空装置、 操作简易和成本低廉等优点，与生物大分子和细胞作用效果明显，通过ARTP与微 生物作用的机理解析和对不同微生物(包括真菌、细菌、微藻等)的突变研究， 发现ARTP是一种新型的微生物基因组快速突变方法，能够成为高效工业微生物菌 种的构建提供重要的平台。 致谢：感谢清华大学工物系李和平副教授在ART方法开发上的合作与支持。感谢 北京市科委(Z07000200540705)、日本JSTCREST、韩中科技局和韩国科学技术研 究院的项目资助。