基于能量因子的基因调控网络重构.pdf

No．1 第29卷第1期 食品与生物技术学报 V01．29 10 2010年1月 ofFoodScienceand Jan．20 Journal Biotechnology 文章编号：1673—1689(2010)01—0134—05 基于能量因子的基因调控网络重构 谭左平1’2， 徐红林1， 王士同“， 堵国成2 (1．江南大学信息工程学院，江苏无锡214122；2．江南大学工业技术教育部重点实验室，江苏 无锡214122) 摘 要：重构基因调控网络有助于探索生命系统的本质问题。线性组合模型以其形式简单和易于 求解的特点被成功应用于基因网络的重构过程中。作者针对线性组合模型只考虑了基因之间的 线性调控关系的缺陷，引入了能量因子的概念，从而使得模型具备了分析基因间的非线性调控关 coli)的SOSDNA修复过程中，实验证明：该模型 系的特性。将模型应用于大肠杆茵(Escherichia 能较好地拟合大肠杆菌的SOSDNA修复过程，进一步提高了调控网络的构建精度。 关键词：基因表达；能量因子；调控网络；DNA修复 中图分类号：Q344 文献标识码：A ReconstructionGene Network on Factor RegulatoryDependbyEnergy TAN Guo—cheng Zuo-pin91～，XUHong—linl，WANGShi—tong“，DU ofIndustrial (1．SchoolofInformation Laboratory Technology，JiangnanUniversity，Wuxi214122，China；2．Key 214122，China) ofEducation，JiangnanUniversity，Wuxi Biotechnology，Ministry of networkcan to theessenceoflife．The Abstract：Reconstruction generegulatory helpexplore LinearCombinationModelhasbeen tothereconstructionofthe successfullyapplied gene andcanbe linear network，sinceit is solved．However，the regulator verysimple easily were consideredinthemode