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CCCTC-结因子(CTCF)入核运输机制的初步研究.pdf
中文摘要
CCCTC。结合因子(CTCF)入核运输机制的初步研究
中文摘要
CTCF(CCCTC.结合因子)是在真核生物中广泛表达且进化保守的11锌指
蛋白。它的ll锌指结构组成DNA结合结构域,并通过不同的组合方式结合到靶
位点处并行使各种各样的功能,包括基因的抑制与激活、基因印记以及染色质绝
缘等。目前,人们对CTCF的功能进行了广泛的研究,但是没有对CTCF的入核
运输过程进行相关的研究。CTCF作为一个与细胞生长增殖及肿瘤发生等相关的
重要调控因子,它的核运输过程关系着其一系列转录调控作用的发挥。
研究发现CTCF这种大分子核蛋白的入核需要其NLS序列识别相应运输受
体,进而被介导入核运输。入核运输的过程除IIl】[mA被TAP/NXF家族成员介导
外,几乎都是由一个完全保守的转运受体超家族——-Karyophe血s家族所运输。
因此,本课题旨在寻找与CTCF存在相互作用的融ryopher如蛋白家族成员,并
初步研究CTCF入核的具体过程及在此过程中存在的调控方式。由于CTCF在细
胞生长增殖、系统发生以及肿瘤发生等方面都起着重要的作用,而且有研究发现
CTCF的细胞分布与乳腺癌的分级及侵袭性密切相关,故我们还初步研究了
CTCF的入核运输过程与肿瘤侵袭性的相关性。
本研究的主要内容是基于基因芯片的数据结果展开的。之前,利用ChIP-0n
蛋白家族成员In啪rtin13(IP013或m佃13)的基因启动子区结合,且数值非常
(Ⅺ)NA4)。以这些数据作为基础,本课题首先利用免疫荧光染色技术以及相应
文献报道的数据探讨了CTCF的表达水平、细胞分布以及肿瘤细胞侵袭性之间的
关系。我们发现在高侵袭细胞中CTCF多分布于细胞质中,而在低侵袭细胞中
CTCF主要集中分布在细胞核内。
然后,本课题利用染色质免疫共沉淀实验验证启动子芯片的结果,进一步证
明CTCF在勿DJ,启动子区有结合。利用半定量PCR和免疫印迹技术检测实验
Ⅺ)NA4蛋白的表达情况,确定CTCF具体的调控作用。实验发现,CTCF的细
●
!塞塑茎
胞表达水平较低的时候,m013和l@NA4的表达量也有不同程度的下调。说明
CTCF对这两种蛋白起正调控作用。
同时,用GST融合蛋白沉降技术以及Co.m实验检测CTCF与口013和
ⅪPNA4蛋白的相互作用情况。GST融合蛋白沉降技术中构建了表达GSB口013
GEX_4T.1.
及GST-la)NA4这两个融合蛋白的表达载体pGEX_4孓1.口013和p
间都存在相互作用。Co.m实验中首先利用CTCF的抗体免疫沉淀下来的蛋白复
合物进行SDS.P!AGE,Wrestem
Blotting时用IP013的抗体进行检测,结果为阳性。
用CTCF抗体检测时结果也呈阳性。
本课题还初步研究了CTcF对其入核运输的自身调控机制,这可以加深我们
对CTCF及其调控网络的了解。
● ‘
13;基因表达调控;
关键词:CCCTC.结合因子;karyophe咖alplla4;hnportin
核运输;
5
英文摘要
themechanismnuclearof
researchabout Of
Preliminary import
factor
CCCTC-binding
Abstract
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