4+q22．1区域+SNP对汉族绝经后妇女骨密度及骨质疏松易感性的作用.pdfVIP

中国骨质疏松杂志　 ２０１５年９月第２１卷第９期　 Ｃｈｉｎ Ｊ Ｏｓｔｅｏｐｏｒｏｓ，Ｓｅｐｔｅｍｂｅｒ２０１５，Ｖｏｌ２１，Ｎｏ． ９ １２０８ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｄ ｏｎｌｉｎｅｗｗｗ．ｗａｎｆａｎｇｄａｔｅ．ｃｏｍ．ｃｎ　 ｄｏｉ：１０３９６９／ ｊ．ｉｓｓｎ．１００６⁃７１０８ ２０１５ ０９０１２ ·论著· ４ｑ２２．１ 区域 ＳＮＰ 对汉族绝经后妇女骨密度及骨质疏 松易感性的作用 １，２，３ ３ ４ ５ １∗ 杨浩杰 　 张玉磊 　 刘丹 　 王治伦 　 贺西京 １．西安交通大学第二附属医院，西安　 ７１０００４ ２．西安交通大学生命科学与技术学院生物医学信息工程教育部重点实验室，西安　 ７１００４９ ３．西安交通大学医院，西安　 ７１００４９ ４．西安市第五医院，西安　 ７１００８２ ５．西安交通大学医学部地方病研究所，西安　 ７１００６１ 中图分类号： Ｒ８１６８　 　 文献标识码： Ａ　 　 文章编号： １００６⁃７１０８（２０１５）１０⁃１２０８⁃０９ 摘要： 目的　 探讨４ｑ２２．１区域易感基因或易感区域的遗传多态性在汉族绝经后女性骨质疏松群体中是否与骨密度（ｂｏｎｅ ｍｉｎｅｒａｌ ｄｅｎｓｉｔｙ，ＢＭＤ）和骨质疏松症（Ｏｓｔｅｏｐｏｒｏｓｉｓ，ＯＰ）易感性相关联。 方法　 使用 ＨａｐｌｏＶｉｅｗ 搜索国际单体型图谱计划 （Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ ＨａｐＭａｐ Ｐｒｏｊｅｃｔ，ＨａｐＭａｐ）数据库位于ｒｓ６５３２０２３上游２０ ｋｂ到下游２０ ｋｂ 区域的所有ＳＮＰ，选择其中在中国北京 汉族群体中次等位基因频率（ＭＡＦ）＞０．０５ 的ＳＮＰ。 我们调查３２个ＳＮＰ，这些ＳＮＰ 的次等位基因频率≥００５，分布于４ｑ２２１ 区域的ｒｓ６５３２０２３位点上游２０ ｋｂ到下游２０ ｋｂ之间。 此位点在欧洲群体研究中报道过与ＯＰ有明显关联性。 应用Ｓｅｑｕｅｎｏｍ ＭａｓｓＡＲＲＡＹ基因分型技术，在样本中对上述位点与 ＢＭＤ及ＰＭＯＰ 的易感性进行关联验证。 结果　 本研究随机收集４４０例病 例样本和６４０例正常对照样本，结果发现在我们的样本中ｒｓ６５３２０２３与ＢＭＤ及ＯＰ具有显著关联性（Ｐ ＝００１５），等位基因Ｇ 是疾病易感因子，而Ｔ为保护因子。 进一步的基因型关联分析也得出了相似的结论（Ｐ＝００４０）。 单倍型分析发现，此区域的 一个单倍域ｒｓ７６８３３１５⁃ｒｓ６５３２０２３⁃ｒｓ１４７１４００⁃ｒｓ１４７１４０３与ＢＭＤ和ＯＰ（Ｐ ＝００３２）相关联，病例组单倍型Ａ⁃Ｇ⁃Ｇ⁃Ｃ群体发病率 是正常对照组的１５倍。 结论　 目前为止，本文是首次探究汉族群体中４ｑ２２１区多态性与ＯＰ 的关联性。 研究结果证明了 ４ｑ２２１区对ＯＰ发病的影响，４ｑ２２１区可能是ＢＭＤ和ＯＰ 的遗传危险因素。 关键词： 绝经后骨质疏松症；骨密度；单核苷酸多态性；单倍型；ＭａｓｓＡＲＲＡＹ 基因分型；关联分析 ４ｑ２２１ ｃｏｎｔｒｉｂｕｔｅｓ ｔｏ ｂｏｎｅ ｍｉｎｅｒａｌ ｄｅｎｓｉｔｙ ａｎｄ ｏｓｔｅｏｐｏｒｏｓｉｓ ｓｕｓｃｅｐｔｉｂｉｌｉｔｙ ｉｎ ｐｏｓｔｍｅｎｏｐａｕｓａｌ ｗｏｍｅｎ ｏｆ Ｈａｎ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ １，２，３ ３ ４ ５ １∗ ＹＡＮＧ Ｈａｏｊｉｅ ，ＺＨＡＮＧ Ｙｕｌｅｉ ，ＬＩＵ Ｄａｎ ，ＷＡＮＧ Ｚｈｉｌｕｎ ，ＨＥ Ｘｉｊｉｎｇ １． Ｔｈｅ Ｓｅｃｏｎｄ Ａｆｆｉｌｉａｔｅｄ Ｈｏｓｐｉｔａｌ ｏｆ Ｘｉ’ａｎ Ｊｉａｏｔｏｎｇ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｘｉ’ａｎ７１０００４ ２．Ｔｈｅ Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ｂｉｏｍｅｄｉｃａｌ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ ｏｆ Ｍｉｎｉｓｔｒｙ ｏｆ Ｅｄｕｃａｔｉｏｎ，Ｓｃｈｏｏｌ ｏｆ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ， Ｘｉ’ａｎ Ｊｉａｏｔｏｎｇ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｘｉ’ａｎ７１００４９ ３． Ｔｈｅ Ｈｏｓｐｉｔａｌ ｏｆ Ｘｉ’ａｎ Ｊｉａｏｔｏｎｇ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｘｉ’ａｎ７１０