《hsa-miR-1908靶基因预测及生物信息学分析 hsa-miR-1908 target genes prediction and bioinformatics analysis》.pdfVIP

· 820 · 临床儿科杂志 第 3 1 卷第 9 期 20 13 年 9 月 J Clin Pediatr Vol.3 1 No.9 Sep .20 13 doi:10.3969 j .issn .1000-3606.20 13.09.006 ·论 著· hsa-miR-1908靶基因预测及生物信息学分析 1、2 1、2 1、2 1、2 1、2 1、2 1、2 1、2 杨　蕾 　季晨博 　史春梅 　陈　玲 　庞玲霞 　夏　黎 　郭锡熔 　倪毓辉 1. 南京医科大学儿科研究所 （江苏南京　210029）； 2. 南京医科大学附属南京妇幼保健院儿童保健科 （江苏南京　210004） 摘要： 目的 　 　对 hsa-miR-1908 进行系统的生物信息学分析，预测其可能参与的生物学过程及信号通路，为深入研究其 在人脂肪细胞分化、肥胖发生等过程中的功能与机制奠定基础。方法　应用 miRBase 获取 hsa-miR-1908 的序列，并分析其 特征；应用 miRanda 预测 hsa-miR-1908 的靶基因，并取预测结果及基因芯片结果的交集，进一步进行基因功能注释（Gene ontology）和生物通路富集分析（Pathway enrichment)。结果　hsa-miR-1908 在各物种之间有一定保守性，其靶基因功能富 集于 Wnt 受体信号的调控、细胞周期、细胞凋亡等生物学过程；其靶基因信号通路富集于促性腺激素释放激素信号通路、 MAPK 信号通路、胰岛素信号通路、细胞周期等信号转导通路及胰腺癌等疾病通路中。结论　hsa-miR-1908 预测的靶基因 集合富集于多个信号通路及生物学过程，与肥胖密切相关，为后续 has-miR-1908 在人脂肪细胞中生物学功能研究奠定基础。 　　　　　 [临床儿科杂志,2013,31(9):820-824] 关键词：　miR-1908；　miRNA ；　生物信息学；　人脂肪细胞；　肥胖 中图分类号： 文献标志码：　 文章编号： 　Q344　　　　 A　　　　 　1000-3606 (2013) 09-0820-05 1,2 1,2 1,2 hsa-miR-1908 target genes prediction and bioinformatics analysis YANG Lei , JI Chenbo , SHI Chunmei , CHEN Ling1,2, PANG Lingxia1,2, XIA Li1,2, GUO Xirong1,2, NI Yuhui1,2 (1.Institute of Pediatrics, Nanjing Medical University, Nanjing 210029, Jiangsu, China; 2.Nanjing Maternity and Child Health Care Hospital Affiliated to Nanjing Medical University, Nan- jing 210004, Jiangsu, China) Abstract: Objective To predict