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第章蛋白质合成精品.ppt
遗传信息流动示意图 13.1 蛋白质合成体系 ⑴遗传密码 (Genetic code) mRNA中蕴藏遗传信息的碱基顺序称为遗传密码。 mRNA分子上以5‘→3’方向,从AUG开始每三个连续的核苷酸(三联体)组成一个密码子(codon) 。 遗传密码的破译先后经历了五十年代的数学推理阶段和1961-1965年的实验研究阶段。 物理学家George Gamov(1954)根据DNA中有4种核苷酸和蛋白质中有20种氨基酸的对应关系,推理认为3个核苷酸编码1个氨基酸,可编码64种氨基酸(43=64)。 Brenner和Grick (1961) 根据DNA链与蛋白质链共线性(colinearity),肯定了3个核苷酸为1个氨基酸编码的推理,随后的实验研究证明此推理是正确的。 Nirenberg和Khorana因破译了遗传密码,共获1968年诺贝尔生理医学奖。 蛋白质合成过程中需要200多种生物大分子参加,包括核糖体、mRNA、tRNA及多种蛋白质因子。 用体外翻译系统可以进行蛋白质的生物合成。如细菌无细胞系统、动物无肝细胞系统、网织红细胞裂解系统和麦胚系统等。只要加入外源mRNA模板,则可进行体外翻译。 Nirenberg和Mathaei(1961)合成了polyU作为模板,加入体外无细胞翻译系统。 polyG 形成三股螺旋,而不与核糖体结合。 核糖体结合技术 如当polyU与核糖体混合时,仅有Phe-tRNA与之结合。 64个三核苷酸(密码子)都可按设想序列合成。 但一些三核苷酸序列与核糖体结合不是很有效。 1965年破译了所有氨基酸的密码子 遗传密码字典 三联体密码的破译 1.起始密码子和终止密码子 AUG是起始密码子,也是Met(或 fMet)的密码子。 原核和真核生物肽链合成的第一个氨基酸都是Met(或fMet);少数细菌中也用GUG做为起始码(起始位点编码fMet,密码表中编码Val)。真核生物偶尔也用CUG作起始蛋氨酸的密码。 密码子UAA、UAG、UGA 是肽链成的终止密码子,不代表任何氨基酸,也称无意义密码子。 现代研究发现终止密码子也可编码氨基酸: No21:UGA:硒代半胱氨酸 Sec (U) No22:UAG:吡咯赖氨酸 Pyl (O) 2. 连续性 (commaless) 3. 简并性 (degeneracy) 4. 通用性 (universal) 蛋白质生物合成整套密码,从原核生物到人类都通用。 密码的通用性进一步证明各种生物进化自同一祖先。 已发现少数例外,如动物的线粒体、植物的叶绿体。 5. 变偶性 (wobble) “摆动假说”认为:碱基间除标准配对外,还可以有非标准的配对。 反密码与密码碱基配对时的摇摆现象 在蛋白质生物合成过程中,tRNA主要起转运氨基酸的作用。由于tRNA分子的同工性,细胞内tRNA的种类(40多种)比氨基酸的种类多。 ②TψC环:TψC环由7个碱基组成,参与tRNA与核糖体表面的结合。 ③额外环或可变环(extro variable loop)。碱基种类和数量(3~18个碱基)高度可变,并富含稀有碱基。 ④反密码子环(anti-cordon loop)。由7个碱基组成,处于中间位的3个碱基为反密码子。反密码子可与mRNA中的密码子结合。毗邻反密码子的3‘端碱基往往为烷化修饰嘌呤,其5’端为U,即U-反密码子-修饰嘌呤。 ①tRNA的三维结构呈倒“L”形。 ②氨基酸接受臂CCA序列和反密码子处于倒L的两端。 ③D环和TψC环形成倒L的角。不同tRNA倒L形的角有轻微改变,允许tRNA执行不同功能时改变其功能。 每种AA至少有1种同工tRNA。运输同一种氨基酸的不同tRNA称为同工tRNA。 tRNA分子中反密码环上反密码子的三个碱基与mRNA分子中的密码子靠碱基配对原则而形成氢键,达到相互识别的目的。 但在密码子与反密码子结合时具有一定摆动性。 AARS存在于细胞浆中,分子量2.27×104~2.7×105,由一个或几个亚基组成,单个亚基间大小差别较大。 AARS活性中心一般含有1或几个-SH,催化中发挥作用。 AARS催化的反应过程分二步进行:首先是氨基酸被AARS活化,生成结合于酶上的氨酰腺苷酸(AA-AMP),然后是tRNA的氨基酰化。 AA-tRNA复合物的形成是非常精确的。tRNA分子结合到酶上时,识别已结合AA-AMP,可将错误的AA-AMP水解掉而加以校正。 一旦一个特殊的氨基酸被连接到tRNA分子上时,在蛋白质合成的后续步骤中便没有任何特异的识别和校正方式。 13.1.3 rRNA和核糖体 核糖体(
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