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- 2016-02-25 发布于贵州
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我国青枯病菌遗多样性研究
摘 要
马铃薯是重要的粮菜兼用作物。马铃薯在生产过程中受到各种病虫的危害,其中由青枯
病菌(Ralstonia solanacearum )引起的马铃薯青枯病是马铃薯的严重危害,研究和探讨我国
存在的青枯病菌生理小种和生化变种,了解青枯病菌的遗传多样性,是有效防治青枯病的基
础。
本实验根据已测序马铃薯青枯病菌小种 3 号菌株的基因组序列,从设计的近 200 对 SSR
引物中经初步筛选获得了 120 对 SSR 引物,并对我国 11 个省(市)的 28 个植物青枯病菌
菌株和 2 个国外青枯病菌菌株进行了 PCR 扩增,主要结果如下:
1.在 120 对 SSR 引物中有 110 对引物表现出了多态性,其中 SSR10288、SSR10305、
SSR10307 多态性很强。
2.供试菌株被聚类为四组:A 组中包含了来自我国不同地区的 15 个青枯病菌,寄主均
为马铃薯,属于生理小种 3 号;B 组中包含有来自不同地区、不同寄主的 9 个青枯病菌,寄
主分别有番茄、花生、茄子、辣椒和甘薯,属于生理小种 1 号;C 组仅有 1 个香蕉青枯病菌,
属于生理小种 2 号;D 组包含来自不同地区的 5 个生姜青枯病菌,属于生理小种 4 号。
3.本实验 SSR 聚类结果表明,青枯病菌的遗传多样性与地理来源关系不明显,而与生理
小种的划分有关。因此,可以利用本实验的 SSR 引物直接对情况病菌的基因组 DNA 进行扩
增对菌株进行初步分类,这为建立马铃薯青枯病菌监测体系奠定了基础。
关键词:马铃薯, 青枯病菌,SSR 分子标记,遗传多样性
I
Abstract
The cultivated potato (Solanum tuberosum L.) is one of the most important food and vegetable
crops in the world. It is ranked fourth in world food production, but is continually threatened by
many pathogens and pests, which annually result in billions of US dollars in losses. Bacterial wilt
(BW) caused by Ralstonia solanacearum (Rs) is a devastating disease of potato. Therefore, It is
necessary to investigate the classfication and diversity of Rs to make the basis for bacterial wilt
control.
In this study, 120 SSR primers were selected from nearly 200 original primers designed
according to the full genome sequence of Rs race 3 isolate. Twenty-eight Ralstonia solanacearum
isolates collected from 11 provinces or cities in china and two isolates obtained from other
countries were examined using these 120 primers by PCR amplification, main results are as
followes:
1. One hundred and ten out of 120 SSR primers combination show high amplification
polymorphi
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