鸡fatp1ftp4基因的克隆、表达及其与屠体性状的关联分析.pdf

鸡FATPl／FATP4基因的克降、表达及其与屠体性状的关联分析 中文摘要 长链脂肪酸如同信号分子一样，也是重要的代谢产物。研究发现在长链脂肪 酸摄取中一些候选蛋白如脂肪酸易位酶(FAT／CD36)，脂肪酸合成蛋白(FABP)， 的摄取和代谢具有重要作用，但都不如FATP对脂质代谢和脂肪相关疾病的影响， 为此，当前对FATP基因家族的研究也逐渐成为了热点。 本研究以四川山地乌骨鸡为试验材料，通过生物信息学分析，获取四川山地 蛋白CDS区的分子克隆，并对其质粒进行了序列测定。运用蛋白质组学分析工 具，对CDS区的基本性质、糖基化位点、磷酸化位点、二级结构等进行了预测， 确定该序列具有FATP家族的结构特点，是鸡FATP家族成员蛋白。 本研究以地方品种四川山地乌骨鸡和培育优质鸡“大恒”S01系为试验材料， 采用SYBRgreen 点两品种间的表达差异，同时分析了四川山地乌骨鸡0周龄，2周龄，4周龄，6 织差异，以及在胸肌，腿肌，心脏，肝脏等组织中FATPl和FATP4基因表达量 的发育性变化。结果表明：FATPl和FATP4在两个品种间的表达差异不显著 达的优势时间点。 共设计10对引物，在8个大恒优质肉鸡群体中，只有4对引物检测到多态，共 检测到5处突变，分别为49360bp(SNPl，G／A)，48195 分别位于外显子3、内含子5、内含子7、内含子7和外显子8内。由于SNP4变 异位点的个体数少，为此我们没有对该位点进行后续的分析。FATPl基因突变位 点与屠宰性状关联分析结果显示：SNPl位点：在70d鸡群中，GG型个体的胸 肌重，腿肌重和胸肌率均显著高于从和AG型个体(P0．05)；在91d鸡群中， AG型个体的活重，屠体重，半净膛重，全净膛重，腿肌重和腿肌率显著高于GG 型个体(P0．05)；在所有鸡群中，AA基因型个体的活重，屠体重，半净膛重和 四川农业大学博士论文 肌重，胸肌率和腿肌率显著高于MM和MN型个体(P0．05)；在91d鸡群中， NN型个体的活重，屠体重，半净膛重和全净膛重显著高于MM和MN型个体 所有鸡群中，NN型个体的活重，屠体重，半净膛重，全净膛重，腿肌重，胸肌 鸡群中，3种基因型个体与所有屠体性状之间都没有显著差异(PO．05)；在所有 鸡群中，从型个体的活重和屠体重显著高于AG型个体(P0．05)。SNP5位点： 在70d鸡群中，MN型个体的活重，屠体重和全净膛重显著高于MM型个体 中，NN型个体的活重，屠体重，半净膛重，全净膛重和腿肌率显著高于MM 在所有鸡群中，NN型个体的腿肌率显著高于MN和NN型个体(PO．05)。单倍 型与8个群体的屠宰性状关联分析结果显示：在70d鸡群中，单倍型组合对活重， 屠体重，全净膛重，胸肌重，腿肌重，皮脂厚，胸肌率和腿肌率的遗传效应达到 显著水平(PO．05)；在91d鸡群中，单倍型组合对活重，屠体重，全净膛重， 半净膛重，皮脂厚，腿肌率和腹脂率的遗传效应达到显著水平(P0．05)；在所 有鸡群中，单倍型组合对活重，屠体重，全净膛重，半净膛重，皮脂厚，腿肌率 和胸肌率的遗传效应达到显著水平(P0．05)。 同样运用PCR．SSCP及测序技术检测突变位点，根据FATP4基因组序列共 设计15对引物，在8个鸡群中，有6对引物检测到多态，共检测到8处突变， 等位基因。FATP4基因单突变位点与屠体性状关联分析结果显示，SNPl位点 (P0．05)：在所有鸡群中，3种基因型与活重，屠体重，半净膛重，全净膛重， 2 鸡FATPl／FATP4培冈的克隆、表达及其与屠体性状的关联分析 在70d和91d鸡群中，3种基因型与所有屠体性状都没有达到显著相关水平 (Po．05)，在所有鸡群中，GG型个体的腹脂重和皮脂厚显著高于AG型个体 和腹脂率的遗传效应达到显著水平(PO．05)；在91d鸡群中，TT型个体的胸肌 率显著高于CT型个体(Po．05)：在所有鸡群中，1T型个体的腹脂重，胸肌率， 在70d鸡群中，TT型个体的胸肌重，腿肌重和腿肌率显著高于CC型个体 中，TT型个体的屠体重，活重，半净膛重和全净膛重显著高于CC型个体 (PO．05)；在所有鸡群中，TC型个体的活重，活重和全净膛重显著高于TT型 所有鸡群中，S№5对应的不同基因型间的皮脂厚性状差异显著(PO．05)。SNP6 性状之间差异不显著(PO．05)。单倍型与8个群体的屠宰性状关联分析结果显