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- 2016-03-17 发布于安徽
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基于SRAP标记的湘产百合核心种质库构建.pdf
— 56— 江苏农业科学 2016年第44卷第1期
童巧珍,高 昱,刘平安,等.基于SRAP标记的湘产百合核心种质库构建[J].江苏农业科学,2016,44(1):56-60.
doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2016.01.014
基于SRAP标记的湘产百合核心种质库构建
童巧珍,高 昱,刘平安,蔡嘉洛,张亚利,樊 悦,易刚强
(湖南中医药大学,湖南长沙410208)
摘要:利用相关序列扩增多态性(SRAP)标记技术,以45份初级种质代表的87份湘产百合种质为材料,通过Pop
Gene32、NTSYS-PC(Version2.1)等软件筛选湘产百合核心种质。结果表明:共获得多态位点218个,物种水平上多
态性比例78.42%;通过对SRAP信息进行遗传多样性分析,使用逐步聚类取样法和分层抽样法筛选出15份核心种
质,占收集资源总数的17.2%;t检验表明,核心种质的有效等位基因数、Neis遗传多样性指数、Shannons信息指数在
0.05水平上与初始种质差异不显著,说明核心种质能很好地代替初始种质。
关键词:湖南省;百合;核心种质;遗传多样性;SRAP;种质资源
+
中图分类号:S682.290.24 文献标志码:A 文章编号:1002-1302(2016)01-056-04
湖南省为我国百合主要产区之一,百合在湖南省各地均 数据。45份初级种质来源及分组信息见表1。
有分布,以湘西自治州龙山县的龙山百合、邵阳市隆回县的龙 1.2 方法
[1] [10-11]
牙百合种植区域最广 。百合集药用、食用、观赏用途为一 1.2.1 分子标记方法 根据改良CTAB法 提取湘产百
[12]
体,具有很高的经济价值。面对日益增长的百合需求,保护和 合种质DNA,参照Li等的原则 ,并作适当改进获得反应体
2+
利用百合种质资源极为重要。近年来,种质资源研究在国内 系。SRAP-PCR扩增反应体系为 20 L,其中 Mg 浓度
μ
外兴起,核心种质作为种质资源群体研究和利用的切入点,开 2.5mmol/L,dNTPs浓度0.2 mol/L,引物浓度0.2 mol/L,
μ μ
展相关研究可以避免遗传上的重复,从而保存丰富的遗传变 Taq酶1U,模板DNA50ng。扩增程序:94℃预变性5min;
[2]
异,是提高种质资源利用率的有效途径 ,但是核心种质研 94℃变性1min,37℃复性1min,72℃延伸2min,5个循环;
[3] [4] [5]
究大多集中在牡丹 、烟草 、水稻 等作物上,湘产百合核 94℃变性1min,50℃复性 1min,72℃延伸2min,35个循
心种质研究尚未见报道。依靠基因型信息处理获得的核心种 环;72℃延伸10min,4℃保存;扩增产物经 1.5%琼脂糖凝
质,主
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