miR319a及靶基因在木薯中的低温响应分析.pdfVIP

生物技术通报 ·研究报告· BIOTECHNOLOGY BULLETIN ( ) 2015, 31 11 :173-178 miR319a 及其靶基因在木薯中的低温响应分析 曾长英  周玉飞  彭明 （中国热带农业科学院热带生物技术研究所，海口 571101） 摘 要 ： 旨在探索miRNA 在木薯低温逆境中的调控作用，前期小RNA 测序筛选出miR319 对低温显著响应，通过实时定 量PCR 方法分析miR319 与其4 个不同靶基因在两个木薯品种的4 种低温处理下的差异表达情况。结果显示，miRNA 与其靶基因 在两个不同木薯品种间的响应不同，4 个低温处理间的响应也不同，miRNA 与各个靶基因的相关系数也不同。比较发现在C4 中 miR319a 与3 个靶基因 （GSTU8除外）负相关性均好于SC124，处理之间在NAH 中的负相关表现最典型，miR319 与4 个靶基因 之间的相关系数从大到小的顺序为 ：MYB33UnknownTCP4GSTU8，预示着MYB33 和Unknown（021030m） 两个靶基因在C4 的 NAH 中是miR319a 更为优先的调控目标。结果表明在木薯的低温逆境适应过程中miR319 对MYB33 和Unknown 两个靶基因的调 控作用值得深入研究。 关键词 ： miR319 ；耐低温 ；靶基因 ；负向调控；相关系数 DOI ：10.13560/ki.biotech.bull.1985.2015.11.015 The Differential Expression Characteristics of miR319 and Four Targets Response to Low Temperature Treatments in Two Cassava Varieties Zeng Changying Zhou Yufei Peng Ming （Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology ，Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences ，Haikou 571101 ） Abstract: To study the regulation roles of microRNAs in cassava low temperature adaption, our early small RNA transcriptome profile identified miR319 response to low temperature in cassava. This study, we assayed the expression patterns of miR319 and its 4 different target genes between two cassava varieties under 4 low temperature treatments based on real-time quantitative polymerase chain reaction（PCR） technique. The results showed that the expression patterns of miR319a and its target genes differed in two different cassava varieties, differed among the four cryogenic treatments, and same to the correl