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表3在Genebank中同部分标准菌株ITS序列同源性比较结果
将0712-2序列在NCB I网站中使用blast程序在Genebank /EMBL /DDBJ基因库中进行同源性搜索,所得结果中相似性最高的前10个标准菌株比较结果见表1。从表1可见,0712-2与雅致放射状毛霉ITS序列相似性高达99% ;且全部为雅致放射状毛霉菌株。因此,确定毛霉0712-2为雅致放射状毛霉。
表 在Gene bank中同部分标准菌株ITS序列同源性比较结果
Tab. The homogy comparison result of ITS sequence with part standard strain
菌株名称 菌株号 序列号 相似性 Actinomucor elegans strain ATCC 52370 1座机电话号码 99% Actinomucor elegans strain ATCC 46123 1座机电话号码 99% Actinomucor elegans strain Ac-116 座机电话号码 99% Actinomucor elegans strain ATCC 22963 1座机电话号码 99% Actinomucor elegans strain CBS 111562 座机电话号码 99% Actinomucor elegans strain SCD12 座机电话号码0 99% Actinomucor elegans strain UAMH 10931 座机电话号码0 99% Mucor mucedo strain MHC-7-10 1座机电话号码 99% Mucor mucedo strain MHC-7-1 1座机电话号码 99% Actinomucor elegans strain Ac-3 座机电话号码 99%
系统发育树构建 综合同源性比对结果和雅致放射毛霉菌株在真菌发育系统中的位置,从Gene bank中选择10个标准菌株的ITS序列,结果见表;应用软件中程序绘制系统发育树,结果见图。ITS序列在Gene bank中的登陆号
Tab.2 The practical ITS sequence g i in Gene bank
菌株名称 菌株号 序列gi号 Actinomucor elegans strain ATCC 52370 1座机电话号码 Actinomucor elegans strain UAMH 10931 座机电话号码0 Ambomucor seriatoinflatus strain SmD71-1 座机电话号码9 Actinomucor elegans ATCC 22963 1座机电话号码 Mucor circinelloides strain CBS 195.68 座机电话号码 Mucor circinelloides isolate R6 座机电话号码7 Mucor hiemalis f. luteus strain FSU 6171 1座机电话号码 Mucor mucedo strain WA0000017113 座机电话号码5 Mucor plumbeus strain A162 1座机电话号码 Fungal sp. ENTOK073 O-3 座机电话号码7 Pilaira sp. Pi-5 1座机电话号码 图1 结果表明,0712-2菌株与雅致放射毛霉菌株的遗传距离比其他菌株小,且0712-2菌株和雅致放射毛霉菌株在一个分支中。由此进一步证明,0712-2 菌株为雅致放射毛霉Actinom ucor elegans。
图 系统发育树
Fig. Phylogenetic tree
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