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蛋白质与酶学 主讲教师:安军 课程介绍 该课程是为我校生命科学学院所属生物科学、生物技术专业开设的专业选修课(D类)。 总学时:36学时 学分: 2学分 每周授课一次 时间:每周二 3 — 4节 地点:新阶202 课程内容 一、蛋白质的共价结构 二、蛋白质的三维结构 三、蛋白质结构与功能的关系 四、蛋白质的分离、纯化和表征 五、酶通论 六、酶促反应动力学 七、酶的作用机制和酶的调节 八、蛋白质组学简介 ? 第一章 蛋白质的共价结构 一、蛋白质通论 (一)?? 蛋白质的化学组成 碳 50% 氢 7% 氧 23% 氮 16% 硫 0 —3% 其他 微量 蛋白质元素组成的特点:蛋白质的平均含氮量为16% 蛋白质含量=蛋白氮×6.25 6.25为16%的倒数,为1g氮所代表的蛋白质量(克数)。 蛋白质按是否仅由氨基酸组成分为类: 1.? 单纯蛋白质(simple protein)2.? 缀合蛋白质(conjugated protein) 单纯蛋白质的分类 缀合蛋白质的分类 蛋白质按生物学功能分类 (一) 蛋白质的形状和大小 根据形状和溶解度大体可分为三大类: 1.? 纤维状蛋白(fibrous protein) 2.? 球状蛋白质(globular protein) 3. 膜蛋白质(membrane protein) 蛋白质的大小 (一)?? 蛋白质构象和蛋白质结构的组织层次 每一种天然蛋白质都有自己特有的空间结构或称三维结构,这种三维结构通常被称为蛋白质的构象。 构型:指在具有相同结构式的立体异构体中取代基团在空间的相对取向 ,不同的构型如果没有共价键的破裂是不能互变的。 构象;是指具有相同结构式和相同构型的分子在空间里可能的多种形态,构象形态间的改变不涉及共价键的破裂。 蛋白质结构的不同组织层次(level,hierarchy) 一级结构(primary structure):指多肽链的氨基酸序列。 二级结构(secondary structure):指多肽链借助氢键排列成自己特有的α螺旋和β折叠股片段。 三级结构(tertiary structure):指多肽链借助各种非共价键(或非共价力)弯曲、折叠成具有特定走向的紧密球状构象。 四级结构(quaternary structure):指寡聚蛋白质中各亚基之间在空间上的相互关系和组合方式。 蛋白质的一级结构是由多肽链主链上共价连接的氨基酸残基决定的。 二级结构和其它高级结构层次主要是由非共价力如氢键、离子键、范德华力和疏水作用决定的。 (四)?? 蛋白质功能的多样性 蛋白质的生物学功能有以下几个方面: (1)?????? 催化 (2)?????? 调节 (3)?????? 转运 (4)?????? 贮存 (5)?????? 运动 (6)?????? 结构成分 (7)?????? 支架结构 (8)?????? 防御与进攻 (9)?????? 异常功能 二、肽 肽是氨基酸的线性聚合物,因此也常称肽链(peptide chain)。蛋白质是由一条或多条具有确定的氨基酸序列的多肽链构成的大分子。 (一)?? 肽和肽键的结构 现在公认蛋白质分子中的氨基酸连接的基本方式是肽键(peptide bond)。—CO—NH—这主要有下列一些实验根据: (1)?????? 蛋白质分子中游离α—氨基和α—羧基是很少的。 (2)?????? 某些人工合成的多肽能被水解蛋白质的蛋白酶所水解。 (3)?????? 包含—CO—NH—基团的化合物如双缩脲(biuret)H2N—CO—NH—CO—NH2能与硫酸铜—氢氧化钠溶液产生双缩脲颜色反应。 (4)?????? 人工合成的多聚氨基酸的X射线衍射图案和红外吸收光谱与天然的纤维状蛋白质十分相似。 (5)?????? 我国在世界上首次人工合成蛋白质—结晶牛胰岛素的成功,完成证明了蛋白质的肽链结构学说的正确性。 (二)?? 肽的物理和化学性质 某些肽的pKa pHpKa [HA] [A—]pHpKa [HA] [A—] (三)?? 天然存在的活性肽 三、蛋白质一级结构的测定 (一)蛋白质测序的策略 (1)测定蛋白质分子中多肽链的数目 根据蛋白质N—末端或C—末端残基的摩尔数和蛋白质的相 对分子质量可以确定蛋白质分子中的多肽链数目。 (2)拆分蛋白质分子的多肽链 如果是寡聚蛋白质,多肽链(亚基)是借助非共价相互作 用缔合的,则可用变性剂如 8 mol/L尿素,6 mol/L盐酸胍或高浓度盐处理,就能使寡聚蛋白质中的亚基拆开。 如果多肽链间是通过共价二硫桥
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