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基于生物信息学方法对一株产纤维素酶细菌的初步分析.pdf
48 2011 年21 (2)
生物技术
基于生物信息学方法对一株产纤维素酶细菌的初步分析
侯进慧,蔡侃,.:fL丈刚
(徐州工程学院,汀.苏徐州 221∞的
摘要:目的:筛选新型产纤维素酶商株,促进纤维素资源利用。方法:利用刚果红染色法,从农产品表面筛选产纤维素酶细
菌,利用 16 S rDNA 序列信息,初步确定较高活性的产酶菌株的分类地位。结果:筛选到 1 株产酶活性较高的菌株Yl 。测序获得
长度为 1405峙的 16S rDNA 序列,提交到美国国立生物技术信息中心 NCBI 基因库中,序列号是町796220。结论:菌株 Yl 是
Pan阳a ananatis , 该文为利用分子生物学技术进行快速细菌分类提供了方法参考。
关键词:纤维素酶; Pantoea ananatis; 16S rDNA
中图分类号:Q93 -331 文献标识码:A doi: 10. 3%9/j. 四:n.1 ∞4 - 311 X. 201 1. 02. 倒6
PriliminaηAnalysis of a Bacterial Strain Producing Cellulase
Based on Bioinformatics
HOU Jin - hui ,CAI Kan ,KONG Wen - gang
(X皿bou Institu怡。,fT,田hnot吨野, Xuzbou 221∞8 , China)
Abstract :Obj侃侃ve: Promoting development of cellulose r,回ouse by screening new strains wi由 cel1ulase activity. Method: Using congon
red staining , strain with cel1ulase activity were screened from fruit and leave of agriculture products and further anditìed wi由 its 16 S rDNA
se甲ence. RJ四川t: A bacterial strain Y 1 with higher cel1ulase activity among several bacteria producing cellulase w臼 isolated. A 1405bp
16S rDNA of Yl was sequenced and submitted to NCBI Genbank and its accession numbers is 盯796220. Cooclusioo:Strain Yl Wiωiden
t谊dω Pan阳aarωnatis. This study provides fast way to classify bacteria with molecular biology method.
Key WOI由:cellulase ;PanlOea ananωis;16S rDNA
纤维素是自然界中分布广泛且产量最丰富的一种碳水化 透到生物学相关的很多研究领域中,更是食品生物工程研究
中不可缺少的重要工具。课题组筛选到一株具有较高的纤维
合物资源,但是由于其难于分解,加上目前获得的纤维素酶的
素酶活性菌株Yl ,总结了利用 16S rDNA 序列对细菌进行初步
活性较低,导致纤维素资源的利用率非常的低。我国纤维素
资源产量非常丰富,仅仅是秸轩和皮壳每年就可达 7 x 108 t
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