微流控芯片DNA计算机在生物医学上的初步应用.pdfVIP

芯片应用 微流控芯片DNA计算机在生物医学上的初步 张宇，解华，李博伟，秦建华·，林炳承‘ 中国科学院大连化学物理研究所大连116023 1引言 当AlanTuring提出了通用的可编程计算机的概念以来，“计算机”这一词的意义就不 仅仅指电子计算机，而且也适用于生物有机体。在有机体内，由DNA转录成mRNA，再由mRNA 翻译成蛋白质的过程严格按照生物固有的原则有序地进行，这与图灵机的计算原理极为相 似，因此可以说，生物体本身就是一台“生物计算机”。一个DNA分子通过核苷酸的不同编 码顺序可以存储大量的信息，两条DNA单链按照A-T、G吒的互补配对的原则可以形成杂交 双链，各种酶按照一定的规则可将DNA分子进行连接和降解，这就使得原来代表一定信息的 DNA分子转化为代表另外一种信息的DNA分子，因此由DNA和酶组成的“DNA计算机”成为 最具有代表性的“生物计算机”。DNA计算机具有存储量大、运算速度快、并行性高、耗能 低，以及资源丰富等优点，用它可以完成传统计算机所不能或难以完成的任务。1994年 开了对DNA计算机的研究。2004年Shapiro小组首次提出了一种微型分子计算机的设想， 在试管内模拟了DNA计算机进入细胞内的情形：利用人工合成的具有一定编码的计算分子与 机体自身的DNA和RNA相互作用，在酶的帮助下，对小细胞肺癌和前列腺癌的多种相关基因 表达情况依次进行判断，并在诊断后释放药物[23。这是DNA计算机首次应用于医学领域， 为癌症等基因相关疾病的诊治提供了新的可能性。显然由于采用试管作为载体，显然无法满 足进入人体细胞的要求。 作者拟以微流控芯片为平台，构建一个医学模型，模拟纳米级的DNA计算机进入机体细 胞后，对与乳腺癌相关的多种基因同时进行计算(诊断)，并于诊断成立后自动释放药物(治 疗)的过程。 2实验部分(略) 3结果与讨论 3．1原理设计及分子设计： 本文作者选取了与乳腺癌最为相关、最有代表性的两种基因C-erbB-2、nm23，利用 DNA分子特有的杂交、变性、酶降解和酶连的特性进行计算。如果两种基因表达情况均符合 乳腺癌的诊断标准，即c-erb-b2表达升高、nm23表达降低，则合成一段完整的药物一自 杀基因HSV—tk／GCV，并将其释放，从而达到治疗的目的；如果两种基因中有一种不符合诊 断标准，则不释放药物。这种计算方法只对病变的细胞进行治疗，而对正常细胞的生理功能 不产生影响。采用人工合成的短链DNA来代替机体内的mRNA，减小mRNA易被破坏的弊端。 原理和分子水平的示意图分别如图1和图2所示。 3．2微流控芯片平台构建： 在一块高度集成的微流控芯片上，对DNA分子杂交、变性、酶降解和酶连等多种生化反 应条件进行了摸索；利用了平台高通量的优势，将两种基因计算模块集成在一起，使两种不 同的计算同时进行，分别判断基因表达升高和降低的情况。 7 ‘通讯联系人：林炳承妊!i!墅i!P：垒￡：塑秦建华j曲i蝗4i￡E：!!：业 基金项目：固家自然科学基金项目：科技部863项目(20∞从022305) 162 微流拄芯，}实验室进腱 目1mm＆gHDM¨■m月fammi目嘻自＆镕n∞Ⅲ《目 ，、 自2搬％控薜片叫^”算机目}乳棒癌|目口自艇治疗*n子木平}毒％ 4小结 作者巳上微流控芯片为平台，构建了～个f}；|于乳腺癌基因诊断并于诊断成立后自动进行治 疗的医学模型。该模型对与乳腺癌相关的两种基因的表达情况同时进行计算，如均符合 诊断标准则自动释放药物进行治疗；如有一种不符台诊断标准，则没有有效的药物释放， 不影响对细胞的生理功能。随着芯片微型化技术、纳米技术的进一步发展，以微小平台 为载体的犬晕的DNA计算机有可能进八机体，由血液带到全身的各处，作为“细胞医生”， 对每一个细胞的基圜袭达情况进行即时的监控，定点地对靶细胞释放药物并将其杀死， 做到“有的破矢”的将疾病消灭于萌芽状态。目前。实验中的各项单元操作正在顺利进 行中，在已有的王作基础上，整个实验最终将在线连续完成。 参考文M