芸芥木葡聚糖内糖基转移酶_水解酶基因EsXTH1的cDNA克隆和生物信息学分析1.pdfVIP

中国油料作物学报 ２０１３，３５（２）：１３１－１３６ ＣｈｉｎｅｓｅＪｏｕｒｎａｌｏｆＯｉｌＣｒｏｐＳｃｉｅｎｃｅｓ ｄｏｉ：１０．７５０５／ｊ．ｉｓｓｎ．１００７－９０８４．２０１３．０２．００４ 芸芥木葡聚糖内糖基转移酶／水解酶基因ＥｓＸＴＨ１ 的ｃＤＮＡ克隆和生物信息学分析 １ ２ １ ３ １ 陈姣荣 ，方　彦 ，孙万仓 ，令利军 ，姜海杨 （１．甘肃省干旱生境作物学重点实验室，甘肃 兰州，７３００７０；２．甘肃农业大学研究测试中心， 甘肃 兰州，７３００７０；３．西北师范大学生命科学学院，甘肃 兰州，７３００７０；） 　　摘要：为了解ＸＴＨ（木葡聚糖内糖基转移酶／水解酶）基因在芸芥自交亲和系突变体 （ｓｅｌｆ－ｃｏｍｐａｔｉｂｉｌｉｔｙ，ＳＣ） 和自交不亲和系（ｓｅｌｆ－ｉｎｃｏｍｐａｔｉｂｉｌｉｔｙ，ＳＩ）育性调控中的作用，分别以芸芥野生型ＳＩ系和突变体ＳＣ为材料，取植株 的全花ｃＤＮＡ为模板，采用ｍＲＮＡ差异显示技术（ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｄｉｓｐｌａｙｒｅｖｅｒｓｅｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎＰＣＲ，ＤＤＲＴ－ＰＣＲ）筛选差 异片段，获得了芸芥ＸＴＨ基因的全长ｃＤＮＡ（ＥｓＸＴＨ１，１０７４ｂｐ）。序列分析表明，ＥｓＸＴＨ１的５′端和３′端非翻译区分 别为３６ｂｐ和１８０ｂｐ，包含１个８５８ｂｐ的开放阅读框，编码一条２８５个氨基酸残基组成的肽链；推导的ＥｓＸＴＨ１蛋白 序列含有ＸＴＨ蛋白的活性部位ＤＥＩＤＦＥＦＬ；芸芥ＥｓＸＴＨ１与其它植物的ＸＴＨ蛋白具有较高的同源性，与拟南芥Ａｔ ＸＴＨ６同源性最高（８９．１％），与拟南芥 ＡｔＸＴＨ７、番茄 ＳｌＸＴＨ７及康乃馨 ＤｃＸＴＨ４的同源性分别为７３％、７３％及 ６９％。分子进化树分析表明，ＥｓＸＴＨ１与ＡｔＸＴＨ７、ＳｌＸＴＨ７、ＤｃＸＴＨ４更近。ＥｓＸＴＨ１具有木葡聚糖内糖基转移酶 （ｘｙｌｏｇｌｕｃａｎｅｎｄｏｔｒａｎ，ＸＥＴ）和水解酶（ｘｙｌｏｇｌｕｃａｎｅｎｄｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ，ＸＥＨ）的功能结构位点，Ｎ端有一个由２３个氨基酸 组成的信号肽。预测认为ＥｓＸＴＨ１与蛋白质分泌相关，与芸芥自交亲和性的调控相关。 关键词：芸芥；自交亲和系；木葡聚糖内糖基转移酶／水解酶；基因克隆；功能预测 中图分类号：Ｓ５６５．９０３　　文献标识码：Ａ　　文章编号：１００７－９０８４（２０１３）０２－０１３１－０６ Ｃｌｏｎｉｎｇａｎｄｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｏｆｘｙｌｏｇｌｕｃａｎｅｎｄｏｔｒａｎｓｇｌｙｃｏｓｙｌａｓｅ ａｎｄｈｙｄｒｏｌａｓｅＥｓＸＴＨ１ｇｅｎｅｉｎＥｒｕｃａｓａｔｉｖａ １ ２ １ ３ １ ＣＨＥＮＪｉａｏ－ｒｏｎｇ，ＦＡＮＧＹａｎ，ＳＵＮＷａｎ－ｃａｎｇ ，ＬＩＮＧＬｉ－ｊｕｎ，ＪＩＡＮＧＨａｉ－ｙａｎｇ （１．ＧａｎｓｕＰｒｏｖｉｎｃｉａｌＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＡｒｉｄＬａｎｄＣｒｏｐＳｃｉｅｎｃｅｓ，Ｌａｎｚｈｏｕ７３００７０，Ｃｈｉｎａ； ２．ＲｅｓｅａｒｃｈａｎｄＴｅｓｔｉｎｇＣｅｎｔｅｒｏｆＧａｎｓｕＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｌａｎｚｈｏｕ７３００７０，Ｃｈｉｎａ； ３．ＳｃｈｏｏｌｏｆＬｉｆｅＳｃｉｅｎｃｅ，ＮｏｒｔｈｗｅｓｔＮｏｒｍａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｌａｎｚｈｏｕ７３００７０，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｔｏｕｎｄｅｒｓｔａｎｄｔｈｅｆｕｎｃｔｉｏｎｏｆｘｙｌｏｇｌｕｃａｎｅｎｄｏｔｒａｎｓｇｌｙｃｏｓｙｌａｓｅ／ｈｙｄｒｏｌａｓｅ（ＸＴＨ）ｇｅｎｅｓｉｎＥｒｕｃａｓａ ｔｉｖａｓｅｌｆｉｎｇａｆｆｉｎｉｔｙｒｅｇｕｌａｔｉｏｎｉｎＥｒｕｃａｓａｔｉｖａ，ＳＣ（ｓｅｌｆ