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靶向bcl2基因短发卡RNA干扰真核质粒表达稳定株筛选和建立论文.doc
靶向bcl2基因短发卡RNA干扰真核质粒表达稳定株筛选和建立论文
沈方臻 林明刚 肖文静 王宁宁
【摘要】 目的 构建针对bcl2基因的短发卡RNA(shRNA)干扰真核质粒表达载体,转染到bcl2基因高表达的胃癌细胞株SGC7901中,并筛选出稳定低表达bcl2基因的细胞株。方法 针对bcl2基因的mRNA序列设计、合成4对寡核苷酸序列,插入质粒载体pGPH1/GFP/Neo中,经脂质体介导转染SGC7901细胞。RTPCR检测bcl2基因在mRNA水平的变化, MTT 法检测bcl2基因沉默后胃癌SGC7901细胞的增殖情况。基因沉默效果最好的一组,经G418筛选以得到稳定表达株。结果 与对照组相比,转染成功后的细胞bcl2基因在mRNA水平均显著下降, 细胞增殖速度明显降低(t=2.41,P 0.05);并筛选出稳定表达shRNA2质粒的阳性克隆。结论本研究成功利用针对bcl2基因的shRNA质粒载体筛选出稳定低表达bcl2基因的SGC7901细胞,为胃癌的基因治疗研究奠定了基础。
【关键词】 基因,bcl2;RNA干扰;质粒
[ABSTRACT] Objective To construct a short, bcl2 genetargeting hairpin RNA (shRNA) plasmid vector, ids. The vectors ine. RTPCR ployed to detect the proliferation of tumor cells after bcl2 gene RNA expression of bcl2 in the transfected cells RNA, id vector. The present study provided basis for research on gene therapy of gastric cancer.
[KEY TT)购自美国Sigma公司;上下游引物由上海生物工程有限公司合成。
1.2 方法
1.2.1 靶向bcl2基因shRNA表达载体的构建根据siRNA的设计原则及质粒载体pGPH1/GFP/Neo的特点,使用BLAST将选定的序列和相应的人基因组数据库进行比较,排除和其他编码序列EST同源的序列,选择4条片段作为bcl2基因干扰片段并设计1条乱序非编码片段作为阴性对照,分别为:位于35~55 bp的GGGAGATAGTGATGAAGTACA,位于354~372 bp的GCTGCACCTGACGCCCTTC,位于435~455 bp的GAGGATTGTGGCCTTCTTTGA,位于527~550 bp的GGATGACTGAGTACCTGAACCGGC,阴性对照为GTTCTCCGAACGTGTCACGT,设计完成后送上海生物工程有限公司合成,得到重组质粒分别命名为pGPH1/GFP/Neobcl 2 shRNA1、pGPH1/GFP/Neobcl 2 shRNA2、pGPH1/GFP/Neobcl 2 shRNA3、pGPH 1/GFP/Neobcl 2 shRNA4以及pGPH1/GFP/NeoshNC,经上海英骏生物技术有限公司进行测序,显示载体构建正确。
1.2.2 细胞培养及转染
胃癌SGC7901细胞株置于含体积分数0.10胎牛血清的RPMI1640培养基中,于37 ℃、含体积分数0.05 CO2细胞培养箱中常规培养,取对数生长期细胞进行实验,以2.5 g/L的胰酶消化传代。按照Lipofectamine 2000说明书进行转染。实验分为阳性干扰组:转染特异性质粒pGPH1/GFP/Neobcl 2 shRNA1~4;阴性对照组:转染非特异性质粒pGPH1/GFP/NeoshNC;空白对照组:未转染质粒。
1.2.3 RTPCR检测bcl2 mRNA的表达
收集以上各组细胞,提取总RNA。取RNA 5 μL,合成cDNA,再PCR扩增。bcl2引物序列:P1(上游)5′GGAGGATTGTGGCCTTCTTTG3′, P2(下游)5′GGTGCCGGTTCAGGTACTCA3′, 扩增产物长为116 bp;同时选取GAPDH 作为内参照,GADPH 引物序列:P1(上游)5′CTGCACCACCAACTGCTTAG3′,P2(下游)5′TGAAGTCAGAGGAGACCACC3′, 扩增片段长度为407 bp。PCR反应参数:94 ℃变性4 min;94 ℃ 30 s,57 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,33个循环; 72 ℃延伸7 min。于15 g/L的TAE琼脂糖凝胶上电泳
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