血液产品测序深度.pdfVIP

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2017-07-03 发布于浙江
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血液产品测序深度.pdf

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血液产品测序深度产品数据量 Panel大小测序深度 40基因 5 G 200 K 25 000 483基因 17 G 1.7 M 10 000 计算方法：测序深度 = 数据量/panel大小有效测序深度 = 去除低质量、冗余数据后的测序深度理论测序深度收样量决定了测序深度、灵敏度一套基因组：~ 3.3 pg 基因组全血血浆 cfDNA 分子数 10 ml 4.5 ml 20-50 ng 6060 - 15000个纯化、捕获原始分子 10 000 个等数据损失有效测序深度必 10 000 × 小结 •  诺易康血液产品40 panel测序采用数据量为5 G，测序深度达25 000×；483 panel数据量17 G，测序深度达10 000 × 。 •  同样采集10 mL血液样本情况下，理论上可提取cfDNA基因组个数为6000 - 15 000个，除去测序过程数据损失后，有效测序深度不会超过10 000 × 。若称有效测序深度几万乘，是不科学的。