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蛋白质组学及其在人类精子研究中的应用.pdf
1722 Journal of Chinese PhysicianDecember,2007,Vol 9,No12
,
蛋白质组学及其在人类精子研究中的应用
廖婷婷(综述),范立青(审校)
(中南大学生殖与干细胞研究所,湖南 长沙 410078)
[关键词] 蛋白质组学;精子;综述[文献类型]
随着人类基因组计划的实施和推进,生命科学研究已进入 的应用和推广。
了后基因组时代。在这个时代,生命科学的主要研究对象是功 1·2 生物质谱技术 如果说双向凝胶电泳技术是分离技术,
能基因组学,包括结构基因组研究和蛋白质组研究等。尽管现 那么生物质谱技术则是鉴定技术。质谱技术的原理并不新鲜,
在已有多个物种的基因组被测序,但在这些基因组中通常有一 但是在80年代早期出现的两种新的离子化技术,使质谱从仅
半以上基因的功能是未知的。目前功能基因组中所采用的策 能分析小分子挥发物质到可以研究生物大分子。80年代末又
略,如基因芯片、基因表达序列分析(SAGE)等,都是从细胞中 发明了两种更新的离子化技术,一种是介质辅助的激光解吸/
mRNA的角度来考虑的,其前提是细胞中mRNA的水平反映了 离子化(MALD I),另一种是电喷雾离子化(ES I),能高效地电
蛋白质表的水平。但事实并不完全如此,从 DNA mRNA蛋白 离一些完整或片断的大分子生物聚合物,可以测定分子量达40
质,存在三个层次的调控,即转录水平调控,翻译水平调控,翻 万的生物大分子。通过肽质量指纹谱(peptide mass fingerprint。
译后水平调控。从mRNA角度考虑,实际上仅包括了转录水平 ing)、肽序列标签(peptide sequence tag)和肽阶梯序列(peptide
调控,并不能全面代表蛋白质表达水平。实验也证明,组织中 ladder sequencing)等方法,结合蛋白质数据库检索可实现对蛋
mRNA丰度与蛋白质丰度并不完全呈相关性,尤其对于低丰度 白质的快速鉴定和高通量筛选 。这些技术可以在各个水平
蛋白质来说,相关性更差。更重要的是,蛋白质复杂的翻译后 上研究蛋白质,为蛋白质研究开辟了新的道路,使蛋白质组研
修饰、蛋白质的亚细胞定位或迁移、蛋白质一蛋白质相互作用等 究从蛋白质鉴定深入到高级结构研究,以及各种蛋白之间的相
则几乎无法从mRNA水平来判断。毋庸置疑,蛋白质是生理功 互作用研究。可以预见,未来的质谱技术必将是从基因组到其
能的执行者,是生命现象的直接体现者,对蛋白质结构和功能 功能的各级水平的蛋白质研究的主要工具。
的研究将直接阐明生命在生理或病理条件下的变化机制。蛋 1·3 生物信息学 生物信息学在基因组学/蛋白质组学的研
白质本身的存在形式和活动规律,如翻译后修饰、蛋白质问相 究中将起特殊的重要作用。因为基因组和蛋白组研究提供的
互作用以及蛋白质构象等问题,仍依赖于直接对蛋白质的研究 数据量之巨大在生物学上是史无前例的,这非同一般的海量数
来解决。虽然蛋白质的可变性和多样性等特殊性质导致了蛋 据必须要有高度自动化的处理,包括数据的输入、储存、加工、
白质研究技术远远比核酸技术要复杂和困难得多,但正是这些 索取以及数据库之间的联系。输入和输出数据必须非常迅速
特性参与和影响着整个生命过程。传统的对单个蛋白质进行 并有质量控制;数据处理需要设计各种特殊软件,对各种不同
研究的方式已无法满足后基因组时代的要求。这是因为:(1) 的分析方法得到的数据进行综合分析;不同的数据库之间要有
生命现象的发生往往是多因素影响的,必然涉及到多个蛋白 高效自动的应答 J。2一D凝胶分离到的上千个蛋白质点,通过
质 (2)多个
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