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仲恺农业技术学院学报,21(1):01~05,2008
Journa/ofZhongkai University ofAgriculture and Technology
文章编号:1006—0774(2008)01—0001—05
Orthogonal design for optimal ISSR—PCR system
in flowering Chinese cabbage
SUN Xue.mei , ,QIAO Ai.rain ,SUN Min ,GUI Teng qin ,
(1.School of Life Sciences,Southwest University,Chongqing 4007 1 5,China;2.Collage of
Agriculture and Landscape,Zhongkai University of Agriculture and Technology,Guangzhou 510225,China)
Abstract:Factors which affected the ISSR—PCR reaction of flowering Chinese cabbage(Brassica campes—
tris L.ssp.Chinensis Var.utilis Tssen.et Lee.),such as concentrations of primer,Taq DNA polymer—
ase,dNTPs and Mg“
, was studied by L1 6(4 )orthogonal test.The optimal ISSR.PCR system for flow—
ering Chinese cabbage was determined.In a total volume of 25 l,containing 2.5 L 10×buffer,2.0
mmol/L Mg“ 0.5 units of Taq DNA polymerase,0.24 mmol/L dNTPs,0.50/,Lmol/L primer and 6O
,
ng of template DNA,clear and reproducibe DNA fragments can be obtained.
Key words:Brassica campestris L.ssp.Chinensis Var utilis Tssen.et Lee.;ISSR;orthogonal design
CLC number:S634 Document code:A
利用正交设计优选菜心ISSR.PCR反应体系
孙雪梅 ,乔爱民 ,孙 敏 ,桂腾琴 ,
(1.西南大学生命科学学院,重庆400715;2.仲恺农业技术学院农业与园林学院,广东广州510225)
摘要:利用正交设计L16(4 )探讨引物、 聚合酶、dNTPs、Mg2 对菜心ISSR—PCR反应的影响.得到适合菜心IS—
SR·PCR反应的最佳体系:在25 反应体系中含2.5 10×buffer,2.0 mmol/L M ,0.5U Taq DNA聚合酶,
0.24 mmol/L dNTPs,0.5~rnol/L引物,60 ng DNA模板.
关键词:菜心;ISSR;正交设计
Inter—Simple Sequence Repeat(ISSR)is a technique in which repeat anchored primers are used to amplify
DNA sequences between two inverted SSR .ISSR markers do not require a prior knowledge of the SSR target se—
quence,furthermore,they are highly reproducible due to their primer length a
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