Piezo2蛋白的生物信息学分析及其在肠道中的表达.pdfVIP

2040 重庆医学2016年 5月第45卷第 15期 · 论 著 · doi：10．3969／j．issn．1671—8348．2016．15．004 Piezo2蛋 白的生物信息学分析及其在肠道 中的表达 白 涛，钱 伟 ，汪 欢 ，张 磊 ，宋 军△，侯晓华 (华 中科技大学同济医学院附属协和医院消化 内科 ，武汉 430022) [摘要] 目的 对Piezo2性质、结构和功能进行预测分析，并检测其在肠道的表达。方法 利用Protparam程序预测人 — ezo2蛋 白基本理化性质 ；TMHMM Serve2．0预测跨膜结构域 ；ProtCompVersion9．0分析亚细胞定位 ；用 SOPMA程序预测其 二级结构；SwIs M0DEL服、务器生成其三维模型。免疫组织化学染色确定 Piezo2在肠道组织的表达位置，以实时定量荧光 PCR检测Piezo2在不同肠段的表达量及与Epacl表达的相关性。结果 Piezo2蛋 白分子式为C14539H22ⅢN3 O4o87Sl3。，相对分 子质量为318．092×10。，等 电点pI=5．82。Piezo2蛋 白存在 35个跨膜结构域 ，并有多个蛋 白修饰位点。免疫组织化学染色发现 Piezo2蛋白表达于肠道上皮与神经节，其在结肠表达水平较回肠丰富(P0．01)，其 中结肠 Piezo2与Epacl在mRNA水平表达 呈正相关(rz一0．65，P0．01)。结论 Piezo2在结肠表达丰富，可能通过Epacl通路参与肠道机械力感知与调控。 [关键词] 肠神经系统；肠黏膜；机械 门控离子通道；Piezo2 [中图分类号] R574．6 [文献标识码] A [文章编号] 1671—8348(2016)15—2040—03 BioinformaticsanalysisofPiezo2anditsexpressiondetection in thegut BaiTao，QianWei，WangHuan，ZhangLei，SongJun ，HouXiaohua (DepartmentofGastroenterology，UnionHospital，TongjiMedicalCollege，HuazhongUniversityof ScienceandTechnology，Wuhan，Hubei430022，China) [Abstract] Objective TopredictandanalysisthephysicalandchemicalpropertiesaswellasthestructureandfunctionofPi— ezo2，andtodetecttheexpressionofPiezo2ingut．M ethods Physicalandchem icalpropertiesofPiezo2werepredictedwithProt— param．TransmembranedomainwaspredictedwithTMHMM Serve2—0．SubeellularlocationwasanalyzedwithProtCompVersion 9．0．ProteinsecondarystructurewaspredictedwithSOPMA program．Three-dimensionalmodelwascreatedwithSW ISS-MODEL． LocationofPiezo2inintestinewasanalyzedwith immunohistochem icalstainingandRT—PCR wasperformedtocomparetheexpres— sionindifferentsegmentofintestineandcorrelationtoEpac1．Results Molecularformulaof：Piezo2wasC14539H22436N3662O4o87S13o withmolecularweightof318．092×10。andisoelectricpoint