河南省9株狂犬病毒的N基因序列分析.pdfVIP

学报 (医学版) UnivJ Med Sci 331 河南省 9株狂犬病毒的N基因序列分析 熊成龙 邵中军 郑 刚 居丽雯 周联娣 姜庆五 (复旦大学公共卫生学院流行病学教研室一公共卫生安全教育部重点实验室 上海 200032； 。第 四军医大学预防医学系流行病学教研室 西安 710032；江西省乐平市人民医院内二科 乐平 333300) 【摘要】 目的 分析河南省 9株狂犬病毒的核蛋 白基因序列，探讨狂犬病毒流行株毒力与致病性的可能变异。 方法 以RT-nested—PCR扩增 9株 2006年 12月分离于河南省信阳市的狂犬病毒街株 ，经纯化、克隆、测序后获 得 9条N基因全长序列，采用生物信息学软件对N基因序列进行分析。结果 9株狂犬病毒核蛋 白在核苷酸及 氨基酸水平上彼此 的同源性分别为 97．5 ～99．3％和 98．4 ～99．8 ；病毒与 CTN疫苗的核苷酸序列 同源性 最高，为 88．9 ～90．1 ，氨基酸序列 同源性为 97．6％～98．0 ；与其他疫苗株相 比，9株病毒与其核苷酸及氨 基酸同源性范围分别为 84．4 ～87．9 和 94．2％～97．3％；与已知的基因 1型狂犬病毒比较，9株病毒核蛋 白 氨基酸序列发生了若干位点的取代 。结论 9株河南省狂犬病毒流行株均属基 因 1型，其核蛋 白在基 因的核苷 酸及推导的氨基酸水平上均有变异 ，这些变异可能影响疫苗对流行株所致狂犬病的保护效果。 【关键词】 狂犬病毒； N基因； 遗传特征； 河南省 【中图分类号】 R373．9 【文献标志码】 A AnalysesonN genesequenceof9rabiesvirus isolatesin Henanprovince，China XIONGCheng—long ，SHAOZhong—jun“，ZHENGGang ，JU Li—wen’， ZHOU Lian-di，JIANG Qing—wu△ (KeyLaboratoryofPublicHealthSafety，MinistryofEducation—DepartmentofEpidemiology，Schoolof PublicHealth，FudanUniversity，Shanghai200032，China；DepartmentofEpidemiology， SchoolofPublicHealth，theForthMilitaryMedicalUniversity，Xi’an710032， ShaanxiProvince，China；DepartmentofSecondInternalMedicine，People’ HospitalofLeping，Leping333300，JiangxiProvince，China) [Abstract] Objective Toanalyze9nucleoproteingenesequencesofrabiesvirusescirculatinginHenan province，China，andtoexploretheprobablemutantontheirpathogenicityandvirulence． Methods N genesequencesof9rabiesvirusesderivedfrom HenanprovincewereamplifiedbyRT-nested-PCR，andthen wereclonedandsequenced．Bioinformaticssoftwarewasusedtodeterminethegeneticcharacteristicsofthese rabiesviruses． Results ThesequencesofN gene