活性小分子功能筛选平台M＆Function的设计与实现.pdfVIP

搪 ‘医 版 复 里亏 学 Sci 2…)【…12N…。 ．，39…(6) 633 Fudan UU nniivv J M ed 活性小分子功能筛选平台M ＆Function 的设计与实现 陈 健 鞠元虎 修 婧 张国庆 南 蓬地 (复旦大学生命科学学院生物多样性与生态工程教育部重点实验室 上海 201)433 。上海生物信息技术研究 中心 上海 200235) 【摘要】 目的 建立一个综合了生物信息学和化学信息学的网络信息平台M Function，致力于新药筛选和 研究。方法 通过数据挖掘，整合小分子药物的名称、结构、功能、分类等信息，建立一个小分子药物信息资源 库 。在此基础上 ，借助基于最大公共子结构(maximumcommonsubstructure，MCS)和 Fingerprint的结构 比对软 件 ，通过统计分析 ，建立了功能预测系统，对活性小分子进行生物学功能预测 。结果 M Function平 台拥有 丰富的数据信息、内嵌的图形显示和数据统计插件人性化 的网站设计 ，具有直观 、高效、简便易用、测试数据结果 可靠等优点。结论 M 8LFunction平 台不仅是一个小分子药物信息资源库 ，也是一个小分子功能预测平 台，可 以为高通量先导化合物的筛选提供信息准备和数据支持。网站可以通过 http：／／lifecenter．sgst．cn／mcs／home． do进 行访 问。 【关键词】 药物数据库 ； 新药筛选 ； 功能预测 【中图分类号】 R915 【文献标 志码】 A doi：i0．3969／j．issn．1672—8467．2012。06。017 Function screeningsystem ofactivesmallmolecule： DesignofM ＆ Functionplatform CHEN Jian ，JU Yuan—hu ，XIU Jing’，ZHANG Guo—qing ，NAN Peng△ (MinistryoJEducationKeyLaboratoryforBiodiversityScienceandEcologicalEngineering，SchoolofLifeSciences， FudanUniversity，Shanghai200433，China； ShanghaiCenterforBioinJormationTechnology，Shanghai200235，China) [Abstract] Objective Todevelopacomprehensive，web—accessibledatabaseM Functioncombining bioinformaticsandcheminformaties，which can dedicateto new drug research and development． M ethods Through data mining，we integrate smallmolecule drug names，structures，functions， classificationsand otherinformation．Then weestablish a smallmoleculedrug information resource library．Basedonthemaximum commonsubstructure-based (MCS-based)andFingerprintalgorithms， andstatisticalanalysis，weestablish thesystem forfunction predictionofactivesmallmolecules． Results Becauseofitscompr