第六章基因的表达与调控.docVIP

6基因的表达与调控(上) 6．1 原核基因表达调控总论 2 6．1．1 原核基因调控机制的类型与特点 3 6．1．2 弱化子对基因活性的影响 5 6．1．3 降解物对基因活性的调节 6 6．1．4 细菌的应急反应 6 6．2 乳糖操纵子与负控诱导系统 6 6．2．1 酶的诱导—寻bc体系受调控的证据 7 6．2．2 操纵子模型及其影响因子 8 6．2．3 lac操纵子DNA的调控区域—P、O区 10 6．2．4 lac操纵子中的其他问题 10 6．3 色氨酸操纵子与负控阻遏系统 11 6．3．1 trp操纵予的阻遏系统 12 6．3．2 弱化子与前导肽 12 6．3．3 top操纵子弱化机制的实验依据 13 6．4 其他操纵子 15 6．4．1 半乳糖操纵子 15 6．4．2 阿拉伯糖操纵子 16 6．4．3 阻遏蛋白LexA的降解与细菌中的SOS应答 18 6．4．4 二组分调控系统和信号转导 18 6．4．5 多启动子调控的操纵子 19 6．5 固氮基因调控 19 6．5．1 根瘤的产生 20 6．5．2 固氮酶 20 6．5．3 与固氮有关的基因及其调控 21 6．5．4 寄主植物基因型对共生体系的影响 24 6．6 转录后调控 24 6．6．1 翻译起始的调控 24 6．6．2 稀有密码子对翻译的影响 25 6．6．3 重叠基因对翻译的影响 25 6．6．4 poly(A)对翻译的影响 26 6．6．5 翻译的阻遏 26 6．6．6 魔斑核苷酸水平对翻译的影响 27  ——原核基因表达调控模式 ． 原核生物及单细胞真核生物直接暴露在变幻莫测的环境中，食物供应无保障，只有能根据环境条件的改变合成各种不同的蛋白质，使代谢过程适应环境的变化，才能维持自身的生存和繁衍。高等真核生物代谢途径和食物来源都比较稳定，但由于它们是多细胞有机体，在个体发育过程中出现细胞分化，形成各种组织和器官，而不同类型的细胞所合成的蛋白质在质和量上都是不同的。因此，不论是真核还是原核细胞都有一套准确地调节基因表达和蛋白质合成的机制。 自然选择倾向于保留高效率的生命过程。在单细胞生物中，使细胞代谢总效率增加的突变细胞生长略快于野生型，只要有足够的时间，突变细胞系将占整个细胞群体的主导地位。例如，在一个每30min增殖一倍的109细菌群体中，若有一个细菌变成了29.5min增殖一倍，大约经过80天的连续生长后，这个群体中的99.9％都将具有29.5min增殖一倍的生长速度(假设培养液被不断地稀释，否则细菌将在一两天内停止生长)。 原核生物细胞的基因和蛋白质种类较少，如大肠杆菌基因组约为4.60×l09共有4 288个可读框。据估计，一个细胞中总共含有107个蛋白质分子，如果每个基因等同翻译的话，任何一个多肽应有2 500个拷贝。但是，这些蛋白质并不是以相同拷贝数存在于每个细胞中的，有些蛋白质的数目相当固定，另一些则变化很大。例如，每个大肠杆菌细胞可以有约15 000个该糖体，与其结合的约50种核糖体蛋白数量也是十分稳定的。糖酵解体系的酶含量很大，其数目也极恒定。此外，如DNA聚合酶、RNA聚合酶等都是代谢过程中十分必需的酶或蛋白质，其合成速率不受环境变化或代谢状态的影响，这一类蛋白质被称为组成型(constitutive)合成蛋白质。另一种类型则被称为适应型或调节型(adaptive or regulated)，因为这类蛋白质的合成速率明显地受环境的影响而改变。例如，一般情况下，一个大肠杆菌细胞中只有15个分子的β—半乳糖σ因子，基因组序列分析后发现在6种σ因子，并根据其相对分子质量的大小或编码基因进行命名(表6—2)，其中是σ70调控最基本的生理功能如碳代谢、生物合成等基因的转录所必须的。 除参与氮代谢的σ54以外，其它5种σ因子在结构上具有同源性，所以统称σ70家族。研究发现，所有σ因子都含有4个保守区(图6—4)，其中第2个和第4个保守区参与结合启动区DNA，第2个保守区的另一部分还参与双链DNA解开成单链的过程。与上述σ因子特异性结合DNA上的-35区和-10区不同，σ因子识别并与DNA上的-24和-12区相结合(图6—5)。在与启动子结合的顺序上，σ70类启动子在核心酶结合到DNA链上之后才能与启动子区相结合，而σ54则类似于真核生物的TATA区结合蛋白(TBP)，可以在无核心酶时独立结合到启动子上。 通过特殊代谢物调节的基因活性主要有可诱导和可阻遏两大类： (1)可诱导调节 是指一些基因在特殊的代谢物或化合物的作用下，由原来关闭的状态转变为工作状态，即在某些物质的诱导下使基因活化。这类基因中最突出的例子是大肠杆菌的乳糖操纵子。大肠杆菌在含有葡萄糖的培养基中生长良好，在