不同养殖时期刺参肠道内菌群结构的分析.pdfVIP

第30卷第4期 大 连 海 洋 大 学 学 报 Vol.30 No.4 20 15 年 8 月 JOURNAL OF DALIAN OCEAN UNIVERSITY Aug. 2015 DOI:10.16535/ ki.dlhyxb.2015.04.001 文章编号:2095-1388(2015)04-0345-06 不同养殖时期刺参肠道内菌群结构的分析 王姣姣, 李丹, 王轶南, 王俊杰, 刘艳萍, 常亚青 (大连海洋大学 农业部北方海水增养殖重点实验室, 辽宁 大连 116023) 摘要:为研究不同养殖时期刺参Apostichopusjaponicus 肠道内的细菌菌群结构, 采用PCR-DGGE技术对 DGGE凝胶中的主要条带进行切割、 回收、 克隆、 测序。 结果表明:3、 4、 5、 6、 9、 10月, 大连瓦房店海 区养殖刺参肠道内细菌 16S rDNA-V3 可变区序列经PCR扩增及 DGGE 电泳后分别获得49、 49、 54、 53、 52、 51个条带; 3月与9月的菌群结构相似度最高, 为67郾9%,4月与10月次之, 为63郾8%; 经条带序列 分析得到43个主要条带对应的核酸序列, 11个与未培养菌相似, 32个与归属为7个细菌类群的细菌序列 相似, 包括琢-变形菌纲、 酌-变形菌纲、 啄-变形菌纲、 黄杆菌纲、 蓝藻纲、 绿弯菌门、 疣微菌门; 琢-变形 菌纲、 酌-变形菌纲、 黄杆菌纲是不同养殖时期刺参肠道内的主要细菌群落, 其中酌-变形菌纲所占比例最 高, 达25郾00% ~35郾71%, 除3月和9月外, 黄杆菌纲的相对含量均高于琢-变形菌纲。 研究表明, 春秋两 季刺参肠道内菌群结构呈现类似的演替变化规律, 琢-变形菌纲所占比例下降, 而酌-变形菌纲与黄杆菌纲 所占比例上升。 关键词:刺参; 肠道内含物; 变性梯度凝胶电泳; 菌群结构 中图分类号: Q959; S94摇 摇 摇 摇 文献标志码: A 摇 摇 刺参Apostichopusjaponicus 是中国重要的海水 中在刺参肠道细菌种类的分析, 而关于刺参肠道菌 养殖种类, 养殖区域分布于辽宁、 山东和河北等地 群季节性变化的研究却鲜有报道。 有关水产养殖动 [1] [9-10] 沿海, 具有巨大的经济效益和社会效益 。 动物 物消化道菌群季节性变化的研究已引起重视 。 肠道内的菌群是肠道的重要组成部分, 水生动物的 本研究中, 应用PCR-DGGE技术对不同养殖时期 肠道菌群与宿主以及所处的水生环境存在相互依赖 刺参肠道内的细菌群落进行了分析, 探讨其演替规 和相互制约的关系, 对营养物质的消化、 吸收等方 律, 以期为深入了解刺参肠道菌群结构和刺参肠道 [2] 面具有重要作用 。 刺参营底栖生活并以沉积物 微生态研究提供更为详尽的资料。 [3] 为食, 细菌在刺参的食物中占据较大的比例 , 1摇 材料与方法 刺参肠道内细菌群落组成直接受到养殖环境中菌群 [4] 变化的影响 。 目前, 有关刺参肠道内细菌群落 1郾1摇 材料 [5] 的研究报道已有不少, 张文姬等