pemer a computational framework with simulation-based error models for inferring genomic structural variants from massive paired-end sequencing datapem计算框架与基于仿真的误差模型推断从大规模基因组结构变异paired-end测序数据.pdfVIP

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2017-09-11 发布于上海
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pemer a computational framework with simulation-based error models for inferring genomic structural variants from massive paired-end sequencing datapem计算框架与基于仿真的误差模型推断从大规模基因组结构变异paired-end测序数据.pdf

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pemer a computational framework with simulation-based error models for inferring genomic structural variants from massive paired-end sequencing datapem计算框架与基于仿真的误差模型推断从大规模基因组结构变异paired-end测序数据

Volume 10, Issue 2, Article R23et al.Korbel2009 Open Access Software PEMer: a computational framework with simulation-based error models for inferring genomic structural variants from massive paired-end sequencing data *†‡ ‡ § ¶ Jan O Korbel , Alexej Abyzov , Xinmeng Jasmine Mu , Nicholas Carriero , ‡ ‡ ‡§ Philip Cayting , Zhengdong Zhang , Michael Snyder and Mark B Gerstein‡§¶¥ Addresses: *Gene Expression Unit, European Molecular Biology Laboratory (EMBL), Meyerhofstr., Heidelberg, 69117, Germany. †EMBL Outstation Hinxton, EMBL-European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, Cambridge, CB10 1SA, UK. ‡Molecular Biophysics and Biochemistry Department, Yale University, Whitney Ave, New Haven, CT 06520, USA. §Department of Molecular, Cellular, and Developmental Biology, Yale University, Whitney Ave, New Haven, CT 06520, USA. ¶Department of Computer Science, Yale University, Prospect Street, New Haven, CT 06511, USA. ¥Program in Computational Biology and Bioinformatics, Yale University, Whitney Ave, New Haven, CT 06520, USA. Correspondence: Jan O Korbel. Email: korbel@embl.de Published: 23 February 2009 Received: 1 September 2008 Revised: 22 December 2008 Genome Biology 2009, 10:R23 (doi:10.1186/gb-2009-10-2-r23) Accepted: 23 February 2009 The electronic version of this article is the complete one and can be found online at /200